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基于新型氨基酸描述符SVICE对肽类药物进行QSAR研究
作者姓名:仝建波  常佳  赵翔  白敏
作者单位:陕西科技大学化学与化工学院;教育部轻化工助剂化学与技术重点实验室;
基金项目:国家自然科学基金资助项目(21275094);教育部轻化工助剂化学与技术重点实验室基金资助项目(2011SZS007);陕西科技大学研究生创新基金资助项目
摘    要:采用20种天然氨基酸的47个information indices描述符、33个connectivity indices描述符和44个eigenvalue-based indices描述符分别进行主成分分析,得出一种新的氨基酸描述符-SVICE.将其分别对三肽血管收缩素转化酶(ACE)、抗菌十八肽(AMP)、苦味活性二肽(BTT)序列表征后,建立结构与活性的SMR-MLR模型,并采用内外部双重验证的方法检验模型的稳定性.所建模型相关统计参量如下:复相关系数(Rcum2)、留一法(LOO)交互校验复相关系数(RCV2)和外部样本校验复相关系数(Qext2)分别为0.988,0.964,0.985;0.990,0.970和0.855;0.949,0.887,0.830.结果表明,运用SVICE描述符建立的MLR模型拟合、预测能力均较好,能较好解释肽类药物的活性与结构间的关系从而为新的强活性肽类药物的分子设计和改造提供了指导.

关 键 词:氨基酸    定量构效关系  SVICE描述符  多元线性回归
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