由3D-QSAR、分子对接和分子动力学模拟研究吲唑类化合物与PI3Kδ抑制剂的相互作用 |
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引用本文: | 张玲,刘鹰翔,赵钟祥,蔡晓力,马玉卓.由3D-QSAR、分子对接和分子动力学模拟研究吲唑类化合物与PI3Kδ抑制剂的相互作用[J].化学通报,2018,81(2):148-157. |
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作者姓名: | 张玲 刘鹰翔 赵钟祥 蔡晓力 马玉卓 |
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作者单位: | 广州中医药大学中药学院,广州中医药大学中药学院,广州中医药大学中药学院,广东药科大学药学院,广东药科大学药学院 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(81270054)和 广东省高等学校优秀青年教师培养计划(Yq2013045) |
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摘 要: | 磷酸肌醇3-激酶δ(PI3Kδ)参与慢性阻塞性肺疾病的炎性过程并且被鉴定为一个新的潜在治疗靶点。本文采用三维定量构效关系(3D-QSAR)、分子对接和分子动力学方法研究了47个吲唑类化合物与P13Kδ激酶的相互作用,并建立了相应的模型。其中,比较分子场分析(CoMFA)模型q~2=0.719,r~2=0.972;比较分子相似性指数分析(CoMSIA)模型q~2=0.649,r~2=0.983,表明所建的QSAR模型具有稳定可靠的预测能力。CoMFA和CoMSIA等势图形象地描述了不同的场效应对活性的影响,其中立体场、疏水场及氢键受体场对活性有较大的贡献。接着采用分子对接探索小分子化合物与P13Kδ的结合模式,结合模式显示吲唑类化合物主要通过氢键作用与疏水作用与P13Kδ紧密结合,并且通过分子动力学模拟进一步验证了对接结果。最后根据等势图、对接模式和分子动力学模拟获取的信息设计了8个化合物,研究表明它们均能与PI3Kδ较好结合。
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关 键 词: | PI3Kδ 分子对接 三维定量构效关系 分子动力学模拟 |
收稿时间: | 2017/9/29 0:00:00 |
修稿时间: | 2017/11/27 0:00:00 |
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