| 儿茶素-胞嘧啶分子间相互作用的密度泛函研究 |
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| 引用本文： | 蔡皖飞,毛双,张姝,操飞,张宏,李来才,田安民. 儿茶素-胞嘧啶分子间相互作用的密度泛函研究[J]. 中国科学:化学, 2011, 0(6): 1017-1023 |
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| 作者姓名： | 蔡皖飞 毛双 张姝 操飞 张宏 李来才 田安民 |
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| 作者单位： | 四川师范大学化学与材料科学学院;四川师范大学生命科学学院;四川大学化学学院; |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助(30870257) |
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| 摘 要： | 采用密度泛函理论的B3LYP方法,在6-31+G*基组水平上研究了儿茶素-胞嘧啶分子间相互作用机制,得到稳定的儿茶素-胞嘧啶复合物11个.计算结果表明氢键对于复合物的稳定性起着重要的作用,并且当复合物形成2个或更多的氢键时,氢键的类型及强度共同决定着复合物的稳定性.我们还应用了分子中的原子(AIM)理论和自然键轨道(NBO)理论对这11种复合物中氢键的性质和特征进行了分析.通过研究发现,所有的氢键复合物进行基组重叠误差(BSSE)校正后的相互作用能为-17.35～-43.27kJ/mol,相互作用能主要由氢键所贡献.振动分析显示,氢键的形成使相对应键的对称伸缩振动频率减小,说明这些复合物中形成的氢键都是正常的红移型氢键,与实验结果相一致.
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| 关 键 词： | 儿茶素 胞嘧啶 DNA碱基 密度泛函理论 氢键作用 |
Density functional theory study on the interaction between catechin and cytosine |
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| CAI WanFei ,MAO Shuang ,ZHANG Shu ,CAO Fei ,ZHANG Hong ,LI LaiCai , TIAN AnMin Departement of Chemistry , Material Science,Sichuan Normal University,Chengdu ,China College of Life Science,Chengdu ,China Departement of Chemistry,Sichuan University,Chengdu ,China. Density functional theory study on the interaction between catechin and cytosine[J]. Scientia Sinica Chimica, 2011, 0(6): 1017-1023 |
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| Authors: | CAI WanFei MAO Shuang ZHANG Shu CAO Fei ZHANG Hong LI LaiCai & TIAN AnMin Departement of Chemistry Material Science Sichuan Normal University Chengdu China College of Life Science Chengdu China Departement of Chemistry Sichuan University Chengdu China |
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| Affiliation: | CAI WanFei 1,MAO Shuang 1,ZHANG Shu 1,CAO Fei 1,ZHANG Hong 2,LI LaiCai 1 & TIAN AnMin 3 1 Departement of Chemistry and Material Science,Sichuan Normal University,Chengdu 610066,China 2 College of Life Science,Chengdu 610100,China 3 Departement of Chemistry,Sichuan University,Chengdu 610064,China |
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| Abstract: | The interacting patterns and mechanism of the catechin and cytosine have been investigated using the density functional theory B3LYP method with 6-31+G*basis set.Eleven stable structures for the catechin-cytosine complexes have been found respectively.The results indicated that the complexes are mainly stabilized by the hydrogen bonding interactions.Theories of atoms in molecules(AIM)and natural bond orbital(NBO)have been utilized to investigate the hydrogen bonds involved in all the systems.The interaction... |
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| Keywords: | catechin cytosine DNA bases density functional theory hydrogen bond |
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