鄱阳湖流域华溪蟹属DNA条形码 |
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引用本文: | 徐武杰,邹节新,白俊,朱春潮,石林波,张小燕,张萌,汪雁,周宪民.鄱阳湖流域华溪蟹属DNA条形码[J].南昌大学学报(理科版),2015,39(4):402. |
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作者姓名: | 徐武杰 邹节新 白俊 朱春潮 石林波 张小燕 张萌 汪雁 周宪民 |
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作者单位: | 南昌大学医学部人体寄生虫学教研室; 南昌大学鄱阳湖环境与资源利用教育部重点实验室; 南昌大学医学部医学遗传与细胞生物学实验室; |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(81260257,81160207,31460156,31560179);江西省自然科学基金(20132BAB205059);江西省医学科研项目(20122025);江西省教育厅项目(GJJ12084);南昌大学研究生创新专项资金(CX2015180) |
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摘 要: | 探讨DNA条形码分子标记作为华溪蟹属(Sinopotamon)淡水蟹类辅助分类工具的可行性。选取分布于鄱阳湖流域的6种华溪蟹属淡水蟹类78个样本,采用线粒体COI和16SrRNA基因片段以及ITS2核基因片段,作为分子标记,结合GenBank数据库中同属序列片段,经DNA提取、引物筛选、PCR扩增、产物纯化测序及测序数据处理和分析,在计算得到的遗传距离和所构建系统发生树进行华溪蟹DNA条形码标准基因的选择。在本实验涉及的淡水蟹类个体及类群的识别上,16SrRNA和ITS2基因片段不适宜作为DNA条形码标准基因,而COI基因片段结合GenBank部分华溪蟹属序列数据分析,可区分本次研究所涉及的75%的物种。以线粒体COI基因片段为DNA条形码标准序列,可作为华溪蟹属淡水蟹类物种鉴定的辅助分类工具。
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关 键 词: | 鄱阳湖流域 华溪蟹属 DNA条形码 COI |
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