MrBayes(MC)~3GPU算法的优化 |
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作者姓名: | 暴洁 夏宏举 周剑夫 王刚 刘晓光 |
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作者单位: | 南开大学信息技术科学学院,天津,300071 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(60903028;61070014)资助项目;天津市科技支撑计划重点项目 |
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摘 要: | 为了进一步提高CPU-GPU协同贝叶斯种系发生算法n(MC)3的并发度,本文在n(MC)3算法基础上提出了优化算法,修改算法并行策略,重组计算次序,削弱相邻计算节点之间的依赖关系,增强GPU空闲单元的利用,实现了更高的加速比,显著提高了算法性能.
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关 键 词: | 种系发生 贝叶斯 CUDA 流 并发度 |
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