L-缬氨酸对精氨酸酶Ⅰ抑制作用的分子动力学模拟 |
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引用本文: | 黄义玲,高雪峰.L-缬氨酸对精氨酸酶Ⅰ抑制作用的分子动力学模拟[J].高等学校化学学报,2016(5):928-931. |
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作者姓名: | 黄义玲 高雪峰 |
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作者单位: | 吉林大学生命科学学院,长春,130012 |
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摘 要: | 利用分子动力学模拟与酶学实验相结合的方法,研究了L-缬氨酸(L-Val)对野生型和突变型精氨酸酶Ⅰ的酶促反应动力学的影响.精氨酸酶Ⅰ的活性口袋附近有一个较大的空穴C2,分子动力学模拟结果显示,突变Ile156Arg缩小了空穴C2的容积,而实验结果表明,L-Val对突变型精氨酸酶Ⅰ抑制剂的半抑制浓度(IC_(50))由3.06 mmol/L升高到6.26 mmol/L,增加了1倍,因此精氨酸酶Ⅰ可能存在一个位于空穴C2的调节位点,并且L-Val可以结合于此干扰精氨酸酶Ⅰ的活性.
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关 键 词: | 精氨酸酶Ⅰ 分子动力学模拟 突变 半抑制浓度 调节位点 L-缬氨酸 |
Molecular Dynamics Simulation of the Inhibition Against Arginase Ⅰ Catalyzed Reaction by L-Val |
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Abstract: | |
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Keywords: | Arginase Ⅰ Molecular dynamics simulation Mutation Half maximal inhibitory concentration (IC50) Regulatory site L-Val |
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