| 基于HPPK靶标酶的分子对接研究——金属离子Mg2＋的影响 |
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| 引用本文： | 赵文娜,邹建卫,蒋勇军,马国正,俞庆森.基于HPPK靶标酶的分子对接研究——金属离子Mg2＋的影响[J].化学学报,2005,63(5). |
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| 作者姓名： | 赵文娜 邹建卫 蒋勇军 马国正 俞庆森 |
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| 作者单位： | (浙江大学宁波理工学院分子设计与营养工程市重点实验室 宁波 315100) |
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| 摘 要： | 6-羟甲基-7,8-二氢喋呤磷酸化酶(HPPK)催化细菌进行叶酸合成反应中的第一步, 即焦磷酰从三磷酸酰酐(ATP)转移到6-羟甲基-7,8-二氢喋呤(HP), 被认为是基于结构虚拟筛选新型抗生素的理想靶标. 本工作分别以HPPK和含有金属离子Mg2＋的HPPK为受体, 以底物类似物为配体进行了对接, 发现活性口袋大小、金属镁离子对对接结果有较大的影响. 特别是金属镁离子的加入不仅可大大提高对接结果的可信度, 同时可增加虚拟筛选的命中率. 这一结果将为设计新的HPPK抑制剂提供一定的理论指导.
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| 关 键 词： | 6-羟甲基-7 8-二氢喋呤磷酸化酶(HPPK) 分子动力学 分子对接 金属离子影响 |
| 收稿时间： | 2004-6-14 |
| 修稿时间： | 2004-11-8 |
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