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| p53-MDM2相互作用的分子力学和动力学研究 | |
| 引用本文： | 程伟渊,梁志强,张庆刚,伊长虹,王伟,王克彦.p53-MDM2相互作用的分子力学和动力学研究[J].原子与分子物理学报,2012,29(3). |
| 作者姓名： | 程伟渊 梁志强 张庆刚 伊长虹 王伟 王克彦 |
| 作者单位： | 1. 山东交通学院外语系,济南,250023 2. 山东交通学院数理系,济南,250023 3. 山东师范大学物理与电子科学学院,济南,250104 |
| 摘 要： | p53-MDM2相互作用的抑制已经成为治疗癌症的新方法.本文特分子动力学模拟和MM-PBSA(molecular mechanics/passion-Boltzman surface area)方法结合起来研究MDM2-p53相互作用机制.结果证明范德华相互作用驱动了MDM2与p53的结合.基于残基-残基相互作用的计算不仅证明p53的三个残基Phe19’,Trp23’和Leu26’与MDM2有较强的相互作用,而且还发现另外两个残基Leu22’和Pro27’也与MDM2有较强的相互作用,这为抗癌药物的设计提供了新靶标.同时也证明CH-CH,CH-π和π-π相互作用驱动了p53在MDM2疏水性裂缝中的结合. |
| 关 键 词： | 分子动力学 MM-PBSA 结合自由能 p53-MDM2相互作用 氢键动力学 |
Insight into p53-MDM2 interaction based on molecular dynamics simulation and molecular mechanics |
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| CHENG Wei-Yuan , LIANG Zhi-Qiang , ZHANG Qing-Gang , YI Chang-Hong , WANG Wei , WANG Ke-Yan.Insight into p53-MDM2 interaction based on molecular dynamics simulation and molecular mechanics[J].Journal of Atomic and Molecular Physics,2012,29(3). | |
| Authors: | CHENG Wei-Yuan LIANG Zhi-Qiang ZHANG Qing-Gang YI Chang-Hong WANG Wei WANG Ke-Yan |
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