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溴代胞嘧啶分子内三螺旋DNA的理论研究
作者姓名:杨林静  刘峁子  李清  王琛  白春礼
作者单位:中国科学院化学研究所!北京100080
基金项目:国家自然科学基金资助项目 !(批准号 :2 95 2 5 30 4)
摘    要:运用分子力学方法研究了 3个含溴代胞嘧啶的分子内三螺旋及相应的未溴代分子内三螺旋DNA .理论结果表明 :当分子内三螺旋Hoogsteen嘧啶链的胞嘧啶被溴代胞嘧啶取代后其稳定性最强 ;而当分子内三螺旋 2条嘧啶链的胞嘧啶同时被溴代后 ,其稳定性最差 .从分子力学计算得到 ,4种分子内三螺旋的碱基以C3′ endo糖环构象为主 .在三螺旋YTCY( 2条嘧啶链中的胞嘧啶均被溴代胞嘧啶取代 )中 ,也含有一定数量的C2′ endo糖环构象 .因此 ,分子内三螺旋YTCY是A DNA和B DNA的综合体 ,而其他 3种三螺旋则是典型的A DNA .

关 键 词:5-溴代胞嘧啶  分子内三螺旋  分子力学
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