| ω-芋螺毒素的定量构效关系与虚拟筛选 |
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| 引用本文： | 丁俊杰,丁晓琴,李大禹,潘里,陈冀胜.ω-芋螺毒素的定量构效关系与虚拟筛选[J].物理化学学报,2014,30(11):2157-2167. |
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| 作者姓名： | 丁俊杰 丁晓琴 李大禹 潘里 陈冀胜 |
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| 作者单位： | State Key Laboratory of NBC Protection for Civilian, Beijing Institute of Pharmaceutical Chemistry, Beijing 102205, P. R. China |
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| 摘 要： | ω-芋螺毒素属于海洋生物活性多肽,由24-31个氨基酸残基组成.特异性作用于电压敏感的钙离子通道(VGCCs),能够直接开发成药物或作为先导化合物进行新药开发.本文应用新型氨基酸残基结构描述符cscales和遗传偏最小二乘算法,对ω-芋螺毒素进行定量构效关系(QSAR)研究,并设计、构建了容量为2244个化合物的N-型和P/Q-型VGCC拮抗剂虚拟组合多肽库,然后分别采用QSAR模型预测和相似性搜索方法对组合多肽库进行了虚拟筛选.研究结果表明,建立的N-型和P/Q-型VGCC拮抗剂QSAR模型均具有较好的预测能力,交叉验证相关系数(CV-r2)均大于0.89.主成分分析和聚类分析结果表明,虚拟组合多肽库中化合物具有较好的结构多样性和差异性.通过虚拟筛选,得到了具有高预测活性的6个N-型和19个P/Q-型钙离子通道拮抗剂,为进一步的合成和活性评价奠定了理论基础.同时,本文建立的多肽QSAR预测模型和虚拟筛选策略,为其它多肽类化合物的定量构效关系研究和虚拟筛选提供了参考.
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| 关 键 词： | ω-芋螺毒素 钙离子通道拮抗剂 QSAR 虚拟筛选 |
| 收稿时间： | 2014-07-16 |
Quantitative Structure-Activity Relationship and Virtual Screening of ω-Conotoxins |
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| DING Jun-Jie;DING Xiao-Qin;LI Da-Yu;PAN Li;CHEN Ji-Sheng.Quantitative Structure-Activity Relationship and Virtual Screening of ω-Conotoxins[J].Acta Physico-Chimica Sinica,2014,30(11):2157-2167. |
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| Authors: | DING Jun-Jie;DING Xiao-Qin;LI Da-Yu;PAN Li;CHEN Ji-Sheng |
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| Institution: | State Key Laboratory of NBC Protection for Civilian, Beijing Institute of Pharmaceutical Chemistry, Beijing 102205, P. R. China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | ω-Conotoxin Calcium channel antagonist QSAR Virtual screening |
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