| 紫杉醚与αβ微管蛋白的分子对接 |
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| 作者姓名： | 徐志广 许旋 袁传能 |
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| 作者单位： | Key Laboratory of Technology on Electrochemical Storage and Power Generation in Guangdong Universities, School of Chemistry and Environment, South China Normal University, Guangzhou 510006, P. R. China |
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| 基金项目： | 广东省自然科学基金 ， 广东省教育部产学研结合专项 |
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| 摘 要： | 采用Insight II/Affinity对紫杉醚与αβ微管蛋白进行分子对接, 共得到10个对接构象. 应用密度泛函B3LYP/6-31G 方法计算对接口袋构象的结合能, 筛选出结合能达-190.53 kJ·mol-1的最优对接构象5. 通过构象分析建立紫杉醚与受体结合的作用模型, 结果表明, 在活性口袋的底部紫杉醚与受体间的作用主要是疏水作用, 而在活性口袋的顶部两者间主要是氢键作用. 氢键作用位置可分为A和B两个作用区, 其中A区有3个氢键, 由C13侧链分别与受体的ASP26和ARG369作用形成; B区也有3个氢键, 是由紫杉醚母环上的极性基团分别与受体的THR276、ARG278和GLN282作用产生的. 紫杉醚与αβ微管蛋白间形成的6个氢键可以有效地将紫杉醚固定在活性口袋中.
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| 关 键 词： | 紫杉醚 αβ微管蛋白 分子对接 |
| 收稿时间： | 2008-04-01 |
| 修稿时间： | 2008-06-18 |
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