溴代胞嘧啶分子内三螺旋DNA的理论研究

运用分子力学方法研究了 3个含溴代胞嘧啶的分子内三螺旋及相应的未溴代分子内三螺旋DNA .理论结果表明 :当分子内三螺旋Hoogsteen嘧啶链的胞嘧啶被溴代胞嘧啶取代后其稳定性最强 ;而当分子内三螺旋 2条嘧啶链的胞嘧啶同时被溴代后 ,其稳定性最差 .从分子力学计算得到 ,4种分子内三螺旋的碱基以C3′ endo糖环构象为主 .在三螺旋YTCY( 2条嘧啶链中的胞嘧啶均被溴代胞嘧啶取代 )中 ,也含有一定数量的C2′ endo糖环构象 .因此 ,分子内三螺旋YTCY是A DNA和B DNA的综合体 ,而其他 3种三螺旋则是典型的A DNA .     

亚精胺诱导λ-DNA凝聚现象的AFM研究

生物体内DNA的紧密堆积存在方式与基因表达的自我调控机制有关 ,因此研究体内凝聚诱导物对DNA凝聚所起的作用具有重要意义 .采用原子力显微镜(AFM )研究了这一体系 .研究表明 :亚精胺可直接诱导λ DNA形成一种特殊的结构———环形凝聚体 ;环形凝聚体的形成受动力学因素 (时间 ,浓度 )影响较大 ;环形凝聚体由纳米级小颗粒紧密排列而成 ;凝聚机制可能是以这些颗粒为组成单元的螺旋盘绕过程 .所得结论对生物体内DNA凝聚过程的理论研究具有重要意义     

扫描探针纳米加工技术的现状与发展趋势

介绍了扫描探针纳米加工技术的基本原理、应用前景和最新进展 ,并讨论了该技术的发展趋势     

Characterization of self-assembled monolayers of thiols on Au(111)

Self-assembled monolayers (SAMs) of n-butanethiol, n-dodecanethiol and their equimolar mixture on Au(111) were prepared and characterized by ellipsometry, contact angle measurement, scanning electron microscopy (SEM), X-ray photoelectron spectroscopy (XPS) and atomic force microscopy (AFM). Results revealed that these SAMs are oriented ultrathin films with the thickness of nanometer scale, and the SAMs were influenced by the molecular chain length, the lattice orientation and cleanliness of the substrates. The surface of the longer chain SAM is hydrophobic. The thicknesses of three SAMs of n-butanethiol, n-dodecanethiol and their mixture revealed by ellipsometry and XPS are about 0.59 - 0.67nm, 1.60- 1.69 nm and 1.23 - 1.32nm, respectively. AFM images further demonstrated that the SAM formed by the mixture has some microdomains with two different thicknesses.     

λ-DNA/Hind Ⅲ,pBR322质粒DNA及变性DNA与酶复合物AFM研究

探索了DNA在云母表面的展层方法。采用低分子量的阳离子去垢剂苯二甲基苄基溴化胺(BAB)和甲酰胺混合溶液,建立了无蛋白微量展层技术,不仅可重复获得适合于原子力显微镜(AFM)观察的DNA样品,而且该方法适合于蛋白质-DNA相互作用的AFM研究。研究发现将)~-DNA/Hind Ⅲ,PBR322质粒DNA在35℃水浴中保温30min以上,再用BAB展层,可使盘绕在一起的DNA链在云母表面完全展开;采用AFM获得了双链DNA和质粒DNA的高分辨图象,并首次观察到了体外变性后的DNA与核酸酶(DNase Ⅰ)所形成复合物的结构。     

2-间氰基苯基-5-氰基苯并噻唑的晶体结构及其同分异构体构象的研究

本文用X射线单晶衍射法测定了2-间氰基苯基-5-氰基苯并噻唑的晶体结构,并用PCILO法对该化合物和另外二个同分异构体进行了构象分析。标题化合物属于单斜晶系,空间群P2_1/c,a=23.793(7),b=3.852(1),c=27.004(11),β=98.40(3)°,z=8,D_计=1.42g/cm~3,F(000)=1072,最后一致性因子R=0.048。该分子及其二个同分异构体的空间群相同,但分子在晶胞中堆积的方式并不相同,—c≡N键的间隔和取向亦不相同。根据对它们堆积情况的详细比较和分析,认为它们在外加适当能量时可能发生不同程度的固态聚合反应。     

4,4’-二苯甲酰基联苯构象的分子力学研究

4,4’—二苯甲酰基联苯有两个三岔点,属于二元三岔共轭体系。从结构式上看,卽可把它作为二苯甲酮骨架的取代产物,又可看作是在联苯骨架上的取代。作为系统研究三岔共轭体系结构效应的部分工作,我们用QCFF/PI+MCA(Quantum Mechanical Extension of the Consistent Force Field to PI Electron System+Molecular Crystal Analysis)程序研究了其晶态和孤立态(气态)构象。研究结果表明,在孤立态中,联苯基的二个苯环的最小二乘     

中国纳米科技研究的现状及思考

十余年前开始发展起来的纳米科技 ,已成为目前受到广泛关注、最为活跃的前沿学科领域 .纳米科技的发展 ,不仅可以使科学家在纳米尺度发现新现象、新规律 ,建立新理论 ,而且还将带来一场工业革命 ,成为 2 1世纪经济增长的新动力 .1　中国的纳米科技研究1 1　发展概况在纳米科技的发展初期 ,中国的科学家已经开始关注这方面的研究 .从 1990年开始 ,中国就“纳米科技的发展与对策”、“纳米材料学”、“扫描探针显微学”、“微米 纳米技术”等方面 ,召开了数十个全国性的会议 .中国科学院还在北京主持承办了第 7届国际扫描隧道显微学会议 (Ｓ…     

STM在微细加工中的应用

 已提出的各种可能机理有束流引起的化学反应,高电流密度使表面局部区域内原子加热导致的局部原子的蒸发、熔化、再结晶等,有些结构可能是由于污染物或针尖材料在表面上的沉淀而产生的.当样品表面有覆层或处于特定的气体或液体氛围下时,用STM仍可在其上产生各种细微结构,其主要方法可分为两类,其一是电子束光刻,其二是电子束辅助淀积和刻蚀,以下分别进行讨论。     

吡嗪衍生物在石墨表面上的自组装单层膜结构

利用扫描隧道显微镜研究了荧光液晶分子2, 5-二-[2-(3, 4-二-十二烷氧基-苯基)-乙烯基]-3, 6-二甲基吡嗪(BPDP12)在石墨表面上自组装单层膜的结构. 实验结果表明, 该化合物在石墨表面形成两种自组装结构：一种是稳定的, 分子的共轭中心相互平行, 烷基链相互交错的密排结构；另一种是不稳定的, 分子的共轭中心彼此为烷基链所分隔的非密排结构. 分子之间较强的π-π作用和分子烷基链之间的范德华作用力对分子组装的取向形成竞争, 是产生两种不同组装结构的根本原因.