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如何筛选合理的数据库匹配结果对于基于质谱的蛋白质组学研究至关重要。但是目前,基于打分体系和反转数据库的筛选方法都无法有效的避免假阳性和假阴性匹配的存在。因此,本文提出了一种系统的搜索策略: 非同质荷比检索规则 (INMZS)。在该策略中,所有匹配结果都需要检查相关匹配质荷比的分享程度,只有那些相关质荷比均为专有匹配时,蛋白质才会被作为可信结果保留,策略还采用迭代搜索方法以提高鉴定低丰度组分的灵敏度。最终,所有的匹配结果由诱饵数据库方法进行评估以得到最终结果列表。INMZS策略在标准蛋白质混合物和大规模人肝蛋白质组数据上进行了模拟及应用,结果显示,INMZS规则和诱饵数据库评估方法的结和可以有效的保证蛋白质组学数据匹配的可信度及灵敏度,可以广泛适用于基于二维凝胶电泳及非shotgun技术的蛋白组学研究中。 相似文献
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回顾性选取肺癌患者86例为肺癌组,同期肺良性结节患者86例为对照组,患者均行双源CT双能量、血清miR-126、miR-204水平检测,发现静脉期标准化碘浓度(NIC)、动脉期NIC、miR-204、miR-126水平在肺癌组中呈异常表达,并与肺癌组病理类型、临床分期、淋巴结转移存在一定相关性,三者联合对肺癌具有一定诊断价值。同时经Kaplan-Meier生存分析可知,肺癌组静脉期NIC、动脉期NIC高水平患者生存率低于低水平患者,而miR-126、miR-204高水平患者生存率高于低水平患者(P<0.05)。早期采用双源CT双能量、血清miR-126、miR-204联合诊断,可为临床诊治、预后评估提供循证指导。 相似文献
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