基于色谱峰形优劣的代谢组学峰检测参数优化算法比较

非靶向代谢组学数据预处理的关键步骤之一为峰检测（Peak picking）,在高分辨质谱的峰检测过程中应用最广泛的算法为基于连续小波变换的cent Wave算法。本研究通过代谢物标准品和尿液两个数据集,结合优良峰形色谱峰比例、可信色谱峰比例和可重复色谱峰比例3个评价指标对IPO(Isotopologue parametersoptimization)和cent Wave Sweep两种cent Wave参数优化算法进行了全面比较。为了快速准确地对色谱峰形优劣进行区分,比较了随机森林（Random forest）、自适应提升（Adaboost）和梯度提升树（Gradient boosting decisiontree） 3种集成学习算法在区分色谱峰形优劣方面的性能。根据准确度和衡量二分类模型精确度的F1分数,选择随机森林建立区分模型（准确度93.5%, F1分数0.938）。研究结果表明,相比于XCMS Online推荐的参数,采用IPO和cent Wave Sweep进行参数优化后,不同数据集的可信色谱峰比例和可重复色谱峰比例均得到了提高,取得了较好的优化效果;但是,对于不同数据集的优...     

轻度富营养化水人工湿地处理系统中植物的特性

比较了杭州植物园人工湿地中7种植物的生长和营养吸收特性.种类包括美人蕉(Canna indica)、香蒲(Typha augusti folia)、芦苇(Phragmites australis)、紫露草(Tradescantia reflexa)、斑茅(5accharum arundinaceum)、黑麦草(Loliump erenne)和灯芯草(JunCus effusus).这些植物生长在用于处理植物园观鱼池轻度营养化水的砂砾床复合垂直流人工湿地系统中.2002年7月中旬,各物种的平均总生物量为348～967 g·m-2.斑茅显示了最高的地上生物量,为853 g·m-2,而黑麦草的地上生物量最小,只有127 g·m-2.植物体中N和P的平均质量浓度分别在16.43～35.33 mg·g-1和1.15～1.61 mg·g-1.最大的植物氮磷积累量分别是27.02 g·m-2和1.46 g·m-2.植物积累量与植物生物量之间显示了一个显著的正线性关系.同时,对这7种植物的生长特性以及在人工湿地中的营养吸收、积累和运用价值进行了分析和比较.其中,对于具有景观功能的植物,通过隔行、轮换收割可以既保持景观效果,又取出湿地中的N和P