细胞周期蛋白依赖性激酶CDK4抑制剂的3D-QSAR研究

采用比较分子场分析法（comparative molecular field analysis，CoMFA）和比较分子相似性指数分析法（comparative similarity indices analysis，CoMSIA），系统研究了57个CDK4酶抑制剂的三维定量结构-活性关系．所建立CoMFA和CoMSIA模型的交叉验证系数q^2值分别为0．656和0．811，非交叉验证相关系数r^2分别为0．954和0．969，都具有较好的预测能力．CoMFA和CoMSIA模型的三维等值图直观地解释了化合物的构效关系，为进一步研究提供了重要依据．     

2-(4''''-正丙基苯)咪唑并[2,1-α]异喹啉的晶体结构

本文测定了新型抗早孕药物 2-(4'-正丙基苯)咪唑并[2,1-a]异喹啉的晶体结构。该化合物分子式为C20H18N2, Mr = 286.38, 晶体属单斜晶系, 空间群为P21/n, 晶胞参数为a = 7.2177(1), b = 7.8036(2), c = 27.429(1) ? b = 90.976(3), V = 1544.67(8) 3, Z = 4, Dc = 1.231 g/cm3, F(000) = 608.00, m(Mo-Ka) = 0.073 mm-1, R = 0.0560, wR = 0.1440, 获得25986个衍射点,其中独立衍射点3795个。在分子结构中, 苯环(C(1)C(6))与环(N(1), C(1)C(9))以及咪唑环共平面, 该平面与苯环(C(12)C(17)所在平面的夹角为10.014。     

2-(4′-正丙基苯)咪唑并[2,1-a]异喹啉的晶体结构

本文测定了新型抗早孕药物2-(4′-正丙基苯)咪唑并[2,1-a]异喹啉的晶体结构.该化合物分子式为C20H18N2,Mr = 286.38,晶体属单斜晶系,空间群为P21/n,晶胞参数为a = 7.2177(1),b = 7.8036(2),c = 27.429(1) A,β＝ 90.976(3)°,V = 1544.67(8)A3,Z = 4,Dc = 1.231 g/cm3,F(000) = 608.00,μ(Mo-Kα)=0.073mm-1,R = 0.0560,wR = 0.1440,获得25986个衍射点,其中独立衍射点3795个.在分子结构中,苯环(C(1)-C(6))与环(N(1),C(1)-C(9))以及咪唑环共平面,该平面与苯环(C(12)-C(17)所在平面的夹角为10.014°.     

Design, Synthesis and Pregnancy-Terminating Activity of 2-Aryl Imidazo[2,1-a]isoquinolines

Introduction Symmetrical trizol bioisosterisms, such as 2-aryl pyrazolo[5,1-a]isoindoles and isoquinolines, pyrazolo- [1,5-a]indoles and quinolines, 2-aryl imidazo[2,1-a]- isoquinolines and isoindoles, 3,5-diaryl-s-triazoles, were shown to be active as non-hormonal post-implantation contragestational agents in various animal species after parenteral administration.1-7 Some compounds had good oral activity.8 Among them, DL204-IT9 [2-(3-ethoxy- phenyl)-5,6-dihydro-s-triazole[5,1-a]isoquinoline…     

抑制剂BD2对PKA与PKC βII的抑制选择性研究

蛋白激酶A (PKA)和蛋白激酶C (PKC)的过度表达导致细胞生长分化异常, 是治疗肿瘤的潜在靶点. 抑制剂BD2对PKA和PKC抑制作用存在高选择性. 为了探讨BD2高选择性机制, 本工作以PKA与BD2复合物的晶体结构为模板, 通过同源模建结合分子对接的方法构建PKC βII与BD2复合物的结构, 并对PKA-BD2复合物和PKC-BD2复合物进行了2.5 ns的分子动力学模拟, 运用MM-GBSA方法计算了结合自由能, 通过能量分解的方法考察PKA和PKC的主要残基与BD2之间的相互作用和识别机制. 结合能分析结果很好地描述了BD2对PKA抑制活性比其对PKC抑制活性高这一实验现象. 氢键分析和能量分解结果共同说明了BD2的B环和酰胺链部分与PKA和PKC中相应位点的残基之间的相互作用存在差异, 这是BD2存在选择性的内在因素. BD2高选择性作用机制的阐明为进一步基于结构的balanol类抑制剂的结构设计和优化提供了合理的指导.     

药物水溶解度的QSAR研究和VolSurf参数

药物的水溶解度与其吸收密切相关。本文利用一种新的计算方法,VolSurf,预测药物的水溶解度并测定有利于药物水溶解度的主要分子特征。被测化合物包括26个结构不同的药物,通过偏最小二乘分析法,对药物水溶解度实验值与分子特征进行相关,得到较好的模型(r2=0.90,q2=0.77)。将化合物分为训练集和预测集进行相关分析,结果表明以18个化合物所建立的训练集模型对其余8个化合物有较好的预测能力,预测的标准偏差(SDEP)为0.59。参数分析表明分子与水相互作用的3个局部能量最小值越小,且它们之间的距离越大,对其水溶解度越有利;亲水性占主导因素的分子有高的水溶解度;分子的疏水性越强,在水中的溶解性越弱;大分子的溶解度较小分子溶解度低。     

两类非甾类终止妊娠药物代谢影响因素理论化学研究

采用半经验AM1量子化学方法计算了两类非甾类终止妊娠化合物的物理化学参数,并用多元线性回归分析法对所研究化合物的代谢强度进行QSAR研究,得到了较好的结果.两个模型互相验证,结果一致,有较高的预测能力.根据所建立的模型,化合物较高的生成热以及主要代谢位置上的前沿电子密度均为代谢的不利因素,这可能与化合物体内代谢历程有关.     

抑制剂BD2对PKA与PKCβⅡ的抑制选择性研究

蛋白激酶A(PKA)和蛋白激酶C(PKC)的过度表达导致细胞生长分化异常,是治疗肿瘤的潜在靶点.抑制剂BD2对PKA和PKC抑制作用存在高选择性.为了探讨BD2高选择性机制,本工作以PKA与BD2复合物的晶体结构为模板,通过同源模建结合分子对接的方法构建PKC βⅡ与BD2复合物的结构,并对PKA-BD2复合物和PKC-BD2复合物进行了2.5 ns的分子动力学模拟,运用MM-GBSA方法计算了结合自由能,通过能量分解的方法考察PKA和PKC的主要残基与BD2之间的相互作用和识别机制.结合能分析结果很好地描述了BD2对PKA抑制活性比其对PKC抑制活性高这一实验现象.氢键分析和能量分解结果共同说明了BD2的B环和酰胺链部分与PKA和PKC中相应位点的残基之间的相互作用存在差异,这是BD2存在选择性的内在因素.BD2高选择性作用机制的阐明为进一步基于结构的balanol类抑制剂的结构设计和优化提供了合理的指导.