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采用粗粒化的分子动力学模拟研究了跨膜多肽,lysine-flanked peptide(KALP),对第四代聚酰胺-胺(PAMAM)树枝形分子形态结构的影响.考虑了中性和酸性两种不同pH环境下两个分子间的相互作用行为.计算了PAMAM分子的回转半径、非球形因子、相对于树枝形分子质心的径向密度分布函数,和两分子间的平均力势.模拟发现在两种pH环境下KALP多肽对树枝形分子的大小、形状及密度分布影响不大,证实了PAMAM树枝形分子内部有一定空间容纳KALP多肽分子.自由能的计算结果表明酸性pH环境中PAMAM分子排斥KALP肽,无法形成复合结构;在中性pH环境中,两种分子也不容易形成稳定的复合结构. 相似文献
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