X-RAY STUDIES ON THE STRUCTURE OF DES-PENTAPEPTIDE INSULIN AT 2.4  RESOLUTION——SOLUTION OF THE PHASE PROBLEM USING THE ANOMALOUS SCATTERING OF CADMIUM AND THE DERIVATION OF A MODEL STRUCTURE

The three dimensional structure of des-pentaptide insulin has been solved at a resolu-tion of 2.4A. The structure determination was achieved without the use of heavy atom de-rivatives, by using only the phase information obtained from the seattering (both real andimaginary) of X-rays by cadmium ions present in the native crystal. Using this phase in-formation, a map, with figure of merit 0.56, was produced which enabled an initial modelof the protein to be constructed. Because of the novelty of this approach to the solutionof the phase problem the procedures used are explained in some detail.     

2.4分辨率去五肽胰岛素结构的X射线研究——DPI分子及其同胰岛素的关系

本文描述了单体胰岛素类似物去五肽(B26—B30)胰岛素的结构。同三方二锌胰岛素结构的详细比较说明,DPI虽然在结构上有一些大的改变,但是基本的二级结构单位仍然完整地保持着。像胰岛素的其他晶形那样,DPI结构比较接近于二锌胰岛素结构中的分子Ⅰ。除了结构表面的改变之外,在分子中心还有一些微妙和广泛的改变。分子在晶体中紧密地堆积,有着许多不同的接触,包括蛋白质-镉相互作用的复合网及大量以水为媒介的接触。分子表面大批疏水基团绕蛋白质群集而成一厚带。晶体结构具有良好的有序性,某些侧链的清晰度和水分子的确定性优于在更具活动性的三方二锌胰岛素六体晶体所得的结果。     

2.4分辨率去五肽胰岛素结构的X射线研究——结构的修正

本文报道起始模型对于X射线实验观测量和已知立体化学观测量作约束参数最小二乘修正的结果.经修正和扩展的模型,不仅包括DPI分子的全部非氢原子和一个镉原子,而且还加进49个水分子.由反常散射和模型信息概率相联合得到相角,各项系数按相角可靠性加权,其2F_o-F_c Fourier综合给出清晰的结果,无明显的对试用模型的偏向.最后得到的模型有合理的立体化学,同理想键长的均方根偏离是0.027A;同观测X射线散射相当吻合,对 10—2.4A分辨率的全部数据其偏离因子R=0.182.     

杂氮三环化合物晶体的X射线衍射研究——Ⅰ.1-硫氰丙基-2,8,9-三氧杂-5-氮杂-1-硅三环[3,3,3,0~(1.5)]十一碳烷的晶体和分子结构

目所指的化合物晶体,属于正交晶系,所属的空间群为Pbca,其晶胞参数为:a=10.575,b=12.215,c=20.786,Z=8。在PW1100四圆衍射仪上收集了1839个独立的衍射数据(I_0>3a(I_0))。晶体结构用直接法解出,经全矩阵和块对角矩阵最小二乘法修正,偏离因子R收敛到0.062。结构测定表明,化合物分子中三个五员环各对应的扭角具有相同的方向,其中两个环的构型基本相同,第三个环略显不同。     

1-二氯甲基-2,8,9-三氧杂-5-氮杂-1-硅三环(3,3,3,0~(1,5)]十一烷的晶体和分子结构

题目所指化合物晶体属单斜晶系,空间群P2_1/a,晶胞参数a=10.256,b=14.809,c=7.171,B=103.4°晶胞中分子数Z=4,晶体密度Dc=1.62gcm~(-3)。由直接法和傅里叶(Fourier)综合解得粗结构,经块对角矩阵最小二乘修正,偏离因子R为0.047。N→Si配位键键长为2.062,三个五员环近乎120°角相交,扭角分别为18.64°,19,34°和18.45°。环上的C(12),C(22),C(32)均偏离环的同一侧,三个环呈风扇形,两个氯原子与三个氧原子呈交叉构象。     

杂氮三环化合物晶体的X射线衍射研究——Ⅱ.1-氯丙基-2,8,9-三氧杂-5-氮杂-1-硅三环[3,3,3,0~(1.5)]十一碳烷-3-酮的晶体与分子结构

题目所指的化合物(NC_6H_(10)O_4Si-CH_2CH_2CH_2Cl)属正交晶系,所属空间群为P2_12_12_1。晶胞参数:a=12.943,b=11.477,c=8.273。Z=4。取1243个可观测独立反射数据,用直接法和Fourier综合解得粗结构,经最小二乘修正,偏离因子R为0.049。三个五员环(Si,O,C,C,N)都有一个较大的扭角,分别为23.7°,41.6°,42.8°。其中带羰基环的最大扭角相对较小(23.7°)。三环最小二乘平面间夹角接近120°,分子中的氯丙基-CH_2CH_2CH_2C1近乎在一个平面上折叠。     

杂氮三环化合物的X射线研究V.2,9,10-三氧杂-6-氮杂-1-硼三环[4,3,3,0~(1,6)]十二烷-3-酮的分子结构

题目所指的化合物是在β位引入羰基扩环而形成六元环的新化合物,是杂氮三环研究中一个有意义的结构模型。它属正交晶系,空间群为Pha2_1,晶胞参数为a=16.913,b=8.138,c=6.123;晶胞内所含的分子数Z=4;计算密度Dc=1.457g·cm~(-3)。 使用PW-1100四圆衍射仪,MoKα射线收集衍射强度。用直接法和付立叶综合解得结构,取3°≤2θ≤50°的630个可观测独立反射数据,经最小二乘法修正,最终偏离因子R=0.088。在化合物中,N→B键长为1.637。     

柳珊瑚酸的分子结构和绝对构型

本文首次应用X射线单晶衍射法证实了一种新的倍半萜骨架,并测定了柳珊瑚酸的分子结构和绝对构型。柳珊瑚酸的晶体属于正交晶系,空间群:D_2~ -P2_12_12_1,晶胞参数:a=16.135,b=13.189,c=12.901,α=β=γ=90°。单胞中分子数为8,不对称单位含两个分子,用直接法导出全部非氢原子位置,经最小二乘法修正后,最终偏离因子R=0.056。文中还对柳珊瑚酸分子的结构进行了讨论,并对核磁共振溶剂效应有关理论进行了较深入的讨论,初步探讨了分子结构与其毒性之间的关系。     

MOLECULAR STRUCTURE AND ABSOLUTE CONFIGURATION OF THE DITERPENE LACTONE, PRAELOLIDE

Praelolide is a new compound which was isolated out from the gorgonian, Menella praelonga (Ridley), collected from the South Sea of China at Zhanjiang, Guangdong. The molecular formula is C_(28) H_(35) O_(12)C1. The research result by X-ray diffraction method on the crystal structure is presented. The compound is orthorhombic with space group P2_12_12, cell dimensions α=16.936, b=16.709, c=10.333, and Z=4. The structure has been solved by direct method and refined to R=0.055 for 2257 unique observable reflexions by least-squares. The molecule is composed of the major conformational isomer in which the three main rings(a six-membered ring, an eight-membered ring, a six-membered ring) take separately the form of chair-chairboat-chair, a five-membered actone ring, a C1 substitution, 4 acetate groups, and a three-membered epoxide ring. The absolute configuration of the molecule has also been determined by statistics (R factor ratio =1.012) and Bijvoet pairs observation. For 30 pairs of the greatest anomalo     

1.5分辨率去五肽(B26—30)胰岛素晶体中的水结构

本文报道1.5分辨率去五肽(B 26—30)胰岛素晶体中的水结构。根据扩充F_0的最后的(2F_o—F_c)Fourier图的检验,所讨论的水模型包括81个水分子(电子密度>0.4 e/~3),约占晶体溶剂的三分之二。以2.4—3.2为氢键范围,51个水分子同蛋白质原子成氢键,占水的63％,其中有12个以单水桥接相邻蛋白质分子,更多的以双水桥接相邻蛋白质分子。在蛋白质分子间的一长狭缝中有一个紧凑的水网,两头两个Cd原子通过三个水分子(配位体)像木桩一样支撑着这个水网,表明Cd原子和水网在分子密堆积中的重要作用。