天花粉蛋白2.6分辨率的晶体学修正

本文报道了用溶剂过滤法改善电子密度图,依据Collins提出的一级结构,重新建立天花粉蛋白分子模型。使用2.6分辨率衍射强度数据和约束参数最小二乘法,对处于晶体学不对称单元中两个天花粉蛋白分子(共3828个非氢原子)进行晶体学修正。修正结果,偏离因子R=0.223,键长根均方误差r.m.s=0.023,新的分子模型和以2F_0-F_o为系数的电子密度图符合甚好。     

Crystal Structure of cis-Dichlorobis-(1,10-phenanthroline) Manganese(Ⅱ)

1INTRODUCTIONRecently,considerableattentionhasbeenpaidtotheinvestigationofcoordinationchemistryofmanganeseindifferentoxidationstatesnotonlybecauseofthediscoveryoftightlyboundmanganeseatomsinvariousbiomolecules[libutalsobecauseoftheirinterestingstructural,magneticandspectroscopicfeatures.Wehavepreparedseveralcomplexesofmanganese(n)withdifferentligands.Thestructuresandfeaturesofthesecompoundsarestudiedsystematically.Inthispaperwedescribethestructureofthecomplexwiththeligandsofphenanthroline…     

正交晶系天花粉蛋白2.4分辨率的晶体结构和分子结构

在酸性条件下(pH=5.4)培养出正交晶系天花粉蛋白晶体。用面探测器收集了X射线衍射强度数据。以C2空间群天花粉蛋白2.6分辨率的晶体结构中的分子模型作为已知结构模型,用分子置换法解出正交晶系P2_12_12_1空间群天花粉蛋白的晶体结构。所得到的初始结构模型先后用模拟退火法和立体化学制约的最小二乘修正技术对原子坐标及温度因子进行修正。最后在2.4分辨率范围内模型的β因子为0.197,键长的均方根误差为0.021,键角距离的均方根误差为0.081。分子结构模型与(2Fo—Fc)为系数的电子云密度图吻合得很好。键长键角合理。结构测定结果表明,P2_12_12_1;空间群天花粉蛋白的分子的空间结构与单斜晶系C2空间群中的分子结构甚为相似。     

天花粉蛋白分子的三维结构

本文报道了我们最近建立的单斜晶胞内一个不对称单元中两个天花粉蛋白分子的模型,指出蛋白分子结构可以划分为大小两个结构域以及二级结构的一些特点,描述了独立单元中以一种非对称方式相关联的两个蛋白分子的差异及其相互作用,并解释了重原子衍生物的结合位置。     

含过氧“桥”双核铁络合物(C_5H_5NC_2H_5)_3[Cl_3FeOFeCl_3][FeCl_4]的晶体结构

近年来,含过氧桥双核铁络合物的研究引起了一些化学家的重视。这类络阴离子中两个高自旋的Fc(Ⅲ)通过桥氧原子的超交换作用,成了低磁性化合物,为磁化学研究提供了一个有趣的课题。人们发现,在绿色的Fe(Ⅲ)卵黄高磷蛋白(Phosritin)中含有氧桥联接的四面体配位的多核Fe(Ⅲ)原子簇。试验用化合物是将FeGl_3、吡啶、乙醇和KSCN放在高压釜中制得的。釜内充CO气体至压力为54kg/     

草酸氧钒钾K_6[(VO)_2(C_2O_4)_5]·4H_2O的晶体和分子结构

K_6[(VO)_2(C_2O_4)_5]·4H_2O的晶体属单斜晶系,空间群为C2/c。a=16.149(5),b=7.304(2),c=23.591(5),β=94.62(2)°,Z=4。晶体结构用直接法解出并经全矩阵最小二乘法修正至R=0.085。晶体中的络阴离子是双核的,每个VO~(2+)被两个草酸根所螯合,且呈顺式排布。另有一个草酸根将两个VO~(2+)连接在一起,该草酸根的C—C键中点位于对称心上。     

The Crystal and Molecular Structure of Trichosanthin at 2.6 Resolution

The crystallographic refinement of trichosanthin has been performed at 2.6 resolution. The crystal and molecular structure of trichosanthin is described in detail in this paper. On summarizing the regularity of the amino acid sequences of eight kinds of ribosome inactivating proteins and combining with the crystal and molecular structure of trichosanthin, fifteen most conservative amino acid residues are analyzed. It is found that four most conservative polar amino acid residues Gln156, Glu160, Arg163 and Glu189 gather on the molecular surface on the boundary of the large and small domains, thus forming the active center of the protein molecule.     

α-羟基乙酸氧钒钾K_2[VO(C_2H_3O_3)_2(C_2H2O_3)]·H_2O的晶体和分子结构

VOSO_4与α-羟基乙酸在水溶液中进行反应,用KOH调节到适当的pH值,制得兰绿色的晶体化合物.晶体属单斜晶系,空间群为P2_1/b.在CAD4 四圆衍射仪上用MoKa射线收集到1714个I≥3σ(I)的独立衍射点.结构用直接法和Patte-rson法结合解出,经全矩阵最小二乘法修正,R=0.060.络合物的中心原子钒与配位体分子的比例为M:L=1:3.三个与钒配位的a-羟基乙酸中,两个是双齿螯合,并互为邻位排布,另一个则是单端络合,形成一种较为独特的配位化合物。     

THE THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF TRICHOSANTHIN MOLECULE

A model completed recently of two trichosanthin molecules in an asymmetric unit belonging to themonoclinic system is reported. It can be seen that the molecular, structure consists of two domains, onelarge and one small, and that there are some features in the secondary structure. The dissimilarity be-tween two molecules as well as their interactions in an independent unit rorrelated in a non-symmetricway has been described. moreover, the binding sites of the heavyatom position in the derivatives are alsodiscussed.