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1.
采用二维NOESY核磁共振波谱结合全原子分子动力学模拟研究了肌肽在水溶液中的构象变化和相互作用. 以分子内距离、回转半径、RMSD以及溶剂可接触表面积等性质进行表征. 分子动力学模拟显示肌肽分子在水溶液中表现出了较高的柔性,其构象在伸展、折叠之间互相转换,大部分情况下是以伸展的构象为主导的,而折叠构象较少. 二维NOESY核磁共振实验证实了模拟的结果,实验与理论得到很好的吻合.  相似文献
2.
采用分子动力学模拟方法结合核磁共振化学位移系统研究了甘氨酰甘氨酸水溶液体系饱和溶解度范围的弱相互作用. 径向分布函数表明体系中不同类型的原子显示出形成氢键的不同能力. 氢键网络分析发现了不同氢键所能形成的分子簇结构. 随温度变化核磁共振化学位移值用于研究形成氢键的变化情况,并和模拟得到的结果进行比较,模拟和实验结果得到了较好的吻合.  相似文献
3.
用分子动力学模拟方法结合核磁共振化学位移和红外光谱结果,研究二甲基亚砜DMSO水溶液在全浓度范围内的结构和弱相互作用. 表明径向分布函数分析,DMSO水溶液中既存在着传统的强氢键又存在C—H…O弱相互作用. 氢键网络分析发现DMSO水溶液体系在水富集区域,水分子倾向于自身缔合形成稳定的分子簇结构,而随着DMSO浓度的逐渐增加,水的有序结构受到破坏. DMSO的摩尔分数为0.35是一个特殊点,多种性质偏离理想混合最远. 水分子和DMSO分子发生了交叉缔合作用形成稳定的分子聚集体. 分子动力学统计的平均氢键数与核磁共振化学位移和红外波数变化数据结果进行比较,结果吻合很好.  相似文献
4.
采用分子动力学模拟方法结合核磁共振化学位移和粘度对尿素水溶液在稀浓度范围内的结构和弱相互作用进行研究. 从径向分布函数(RDF)分析看出,尿素水溶液中存在着几种不同类型、不同氢键形成能力的传统氢键. 氢键网络分析发现尿素水溶液体系在水富集区域,水分子倾向于自身缔合形成稳定的分子簇结构,而随着尿素浓度的逐渐增加,水的有序结构受到破坏,水分子和尿素分子发生了交叉缔合作用形成氢键,尿素分子有形成自身缔合的趋势. 分子动力学统计的平均氢键数与核磁共振化学位移和粘度数据结果进行比较,发现它们的变化趋势一致,证明了实验和理论结果有很强的可靠性.  相似文献
5.
采用分子动力学模拟方法结合核磁共振化学位移系统研究了N,N-二甲基乙酰胺(DMA)水溶液体系全浓度范围的弱相互作用. 并对动力学模拟结果和核磁共振化学位移进行了比较. 径向分布函数表明体系中强氢键和C-H···O弱相互作用并存. 氢键网络分析体现了DMA水溶液结构中存在着不同的溶液结构区域. 随浓度和温度变化核磁共振化学位移值用于研究形成氢键的变化情况,并和模拟得到的结果进行比较,模拟和实验结果得到了较好的吻合.  相似文献
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