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1.
采用比较分子场分析方法(CoMFA)和比较分子相似性指数分析方法(CoMSIA)对一系列吡啶并嘧啶类衍生物进行了三维定量构效关系(3D-QSAR)研究,建立了CoMFA和CoMSIA两种模型. 所构建的最佳模型的交叉验证相关系数分别为0.707和0.645,非交叉验证系数分别是0.964和0.972,模型的一些外部验证表明两个模型合理、可靠,并具有良好的预报能力. 同时,用分子对接的方法分析了该类化合物与Wee1激酶结构的作用模式,结果进一步表明,在R1和R5取代基上引入正电性基团,R2为体积小的电负性基团,同时选择体积中等和强的推电子的R3但亲水性的X取代基,能有效改善这类化合物的抑制活性.  相似文献
2.
采用二维NOESY核磁共振波谱结合全原子分子动力学模拟研究了肌肽在水溶液中的构象变化和相互作用. 以分子内距离、回转半径、RMSD以及溶剂可接触表面积等性质进行表征. 分子动力学模拟显示肌肽分子在水溶液中表现出了较高的柔性,其构象在伸展、折叠之间互相转换,大部分情况下是以伸展的构象为主导的,而折叠构象较少. 二维NOESY核磁共振实验证实了模拟的结果,实验与理论得到很好的吻合.  相似文献
3.
为了解决CH基团中氢原子的精确化学位移值的问题,引入相对化学位移值概念.内标法和外标法用于测量全浓度范围的N-甲基乙酰胺水溶液.对于同一个分子来说,选择分子内某个基团的氢原子化 学位移作为一个标准值,得到的其它基团氢原子相对化学位移值随温度和浓度的变化是和测试方法无关的.  相似文献
4.
应用电磁学理论、机械力学以及电子技术自制了一套太阳能磁悬浮演示仪,该演示实验仪由太阳能电池供电,利用线性霍尔传感器来探测悬浮物体的位移,以达到控制悬浮的目的,添加数码管电压显示电路,可以定量显示电磁铁的磁性在悬浮过程中随悬浮物位置变化的自动调整,能精确而直观地演示磁悬浮的物理现象.该仪器结构简单、性能稳定、操作方便,能广泛用于课堂演示、课程设计等场合,在实际应用中取得了良好的教学效果.  相似文献
5.
采用分子动力学模拟方法结合核磁共振化学位移系统研究了甘氨酰甘氨酸水溶液体系饱和溶解度范围的弱相互作用. 径向分布函数表明体系中不同类型的原子显示出形成氢键的不同能力. 氢键网络分析发现了不同氢键所能形成的分子簇结构. 随温度变化核磁共振化学位移值用于研究形成氢键的变化情况,并和模拟得到的结果进行比较,模拟和实验结果得到了较好的吻合.  相似文献
6.
合成了一种罗丹明B酰胺-氧杂杯芳烃衍生物1.在以Tris-HCl作为缓冲体系的乙腈溶液(pH 7.0)中,化合物1本身无色且无荧光,加入Sb3+后,1的螺环结构打开,观察到显著的荧光增强和颜色变红.再加入Ca2+则导致1-Sb3+配合物的荧光猝灭及红色消失.在此条件下,其他共存离子没有明显响应.因此1-Sb3+配合物可作为检测Ca2+的超分子荧光和比色化学传感器.  相似文献
7.
用分子动力学模拟方法结合核磁共振化学位移和红外光谱结果,研究二甲基亚砜DMSO水溶液在全浓度范围内的结构和弱相互作用. 表明径向分布函数分析,DMSO水溶液中既存在着传统的强氢键又存在C—H…O弱相互作用. 氢键网络分析发现DMSO水溶液体系在水富集区域,水分子倾向于自身缔合形成稳定的分子簇结构,而随着DMSO浓度的逐渐增加,水的有序结构受到破坏. DMSO的摩尔分数为0.35是一个特殊点,多种性质偏离理想混合最远. 水分子和DMSO分子发生了交叉缔合作用形成稳定的分子聚集体. 分子动力学统计的平均氢键数与核磁共振化学位移和红外波数变化数据结果进行比较,结果吻合很好.  相似文献
8.
采用分子动力学模拟方法结合核磁共振化学位移和粘度对尿素水溶液在稀浓度范围内的结构和弱相互作用进行研究. 从径向分布函数(RDF)分析看出,尿素水溶液中存在着几种不同类型、不同氢键形成能力的传统氢键. 氢键网络分析发现尿素水溶液体系在水富集区域,水分子倾向于自身缔合形成稳定的分子簇结构,而随着尿素浓度的逐渐增加,水的有序结构受到破坏,水分子和尿素分子发生了交叉缔合作用形成氢键,尿素分子有形成自身缔合的趋势. 分子动力学统计的平均氢键数与核磁共振化学位移和粘度数据结果进行比较,发现它们的变化趋势一致,证明了实验和理论结果有很强的可靠性.  相似文献
9.
Despite the efficacy of imatinib therapy in chronic myelogenous leukemia, the development of drug-resistant Abl mutants, especially the most difficult overcoming T315I mutant, makes the search for new Abl T315I inhibitors a very interesting challenge in medicinal chemistry. In this work, a multistep computational framework combining the three dimensional quantitative structure-activity relationship (3D-QSAR), molecular docking, molecular dynamics (MD) simulation and binding free energy calculation, was performed to explore the structural requirements for the Abl T315I activities of benzimidazole/benzothiazole derivatives and the binding mechanism between the inhibitors and Abl T315I. The established 3D-QSAR models exhibited satisfactory internal and external predictability. Docking study elucidated the comformations of compounds and the key amino acid residues at the binding pocket, which were confirmed by MD simulation. The binding free energies correlated well with the experimental activities. The MM-GBSA energy decomposition revealed that the van der Waals interaction was the major driving force for the interaction between the ligands and Abl T315I. The hydrogen bond interactions between the inhibitors and Met318 also played an important role in stablizing the binding of compounds to Abl T315I. Finally, four new compounds with rather high Abl T315I activities were designed and presented to experimenters for reference.  相似文献
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