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1.
为了探究丝氨酸蛋白酶催化效率的来源,本文分别研究了丝氨酸酶催化水解多肽CI2、MCTI-A和六肽(SUB)的过程中催化三元组内的氢键所起的作用. 首先采用QM/MM-MD方法计算了在酶-底物复合物和过渡态下组氨酸和天冬氨酸之间质子转移的自由能曲线. 结果表明低能垒氢键仅在CI2酰化反应的过渡态区域形成,而在MCTI-A和SUB酰化反应中均是正常氢键. 与MCTI-A相比,CI2和SUB体系中氢键强度在过渡态时显著增强,因此相应的酰化反应能垒明显降低. 过渡态区域形成的低能垒氢键显然有助于加速酰化反应,同时研究也表明正常氢键也有可能降低能垒. 氢键降低能垒的关键则在于过渡态下氢键强度的增加程度,而不是其是否生成了低能垒氢键. 本文为研究催化三元组间的氢键在丝氨酸蛋白酶中的作用提供了新思路,并有助于理解丝氨酸蛋白酶中催化三元组的催化机制.  相似文献   
2.
用超分子MP4方法和大基组(aug-cc-pVTZ)及键函数得到He-N2O体系的分子间从头算势能面及偶极矩面.用离散变量表象方法计算了^4He-N2O及^3He-N2O体系的振转能级,并进一步计算得到其振转跃迁强度,计算结果很好地解释了实验现象。  相似文献   
3.
周燕子  谢代前  卢语晖 《化学学报》2002,60(8):1405-1410
利用量子力学方法研究了二氧化碳振动高激发态的能级及其统计分布。在 Radau坐标下采用算法稳定,精度高且所需计算机内存较少的Lanczos算法以及势能 优化的离散变量表象方法,获得了20000 cm~(-1)以下的所有振动束缚态能级,并 对这些振动能级进行了指认。此外,还进一步分析了振动高激发态的Fermi共振与 非谐性振动。统计分布表明,二氧化碳的振动光谱在20000 cm~(-1)以下呈规则分 布。  相似文献   
4.
OCS电子基态势能面与振动光谱的理论研究   总被引:3,自引:0,他引:3  
卢语晖  周燕子  谢代前  鄢国森 《化学学报》2000,58(12):1516-1521
本文采用键长-键角内标系下的自洽场-组态相互作用方法精确计算了OCS分子的振动高激发态能级,并结合实验观测到的振动能级利用非线性最小二乘法优化电子基态势能函数中的势能参数。由优化所得的势能面计算出的振动激发态能级与50个实验观测到的振动能级比较,标准偏差为0.08cm^-^1。此外,还用该势能面计算了OCS同位素分子的振动能级,计算结果与实验值也十分吻合。  相似文献   
5.
对Ar-D232S转动光谱进行了理论研究.该体系的分子间势能面是由最近报道的Ar-D232S体系的从头算三维势能面转换而来.通过采用径向离散变量表象与角度有限基组表象相结合的方法和Lanczos算法,计算了复合物的转动能级和波函数.结果表明,理论计算得到的转动跃迁频率和结构参数与实验值吻合较好  相似文献   
6.
用超分子MP4方法和大基组(aug-cc-pVTZ)及键函数得到He-N2O体系的分子间从头算势能面及偶极矩面, 用离散变量表象方法计算了 4He-N2O及 3He-N2O体系的振转能级, 并进一步计算得到其振转跃迁强度, 计算结果很好地解释了实验现象.  相似文献   
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