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利用PM3、HF和BHandHLYP方法的结合,系统寻找了甘氨酸-苯丙氨酸-甘氨酸-甘氨酸(GFGG)四肽在气相中的稳定构型.对该构型寻找方法进行了详细的描述,并给出了一些重要构型的基本参数,如电子能、零点振动能、偶极矩、转动常数、垂直电离能和不同温度的构型分布等.通过对重要构型结构特征的分析,发现熵的效应是决定构型稳定性的重要因素,并讨论指出了对构型偶极矩和特征振动模的测量是验证理论预言的有效途径.对GFGG构型与蛋白质二级结构的联系的分析表明,GFGG低能构型出现了类似于α-螺旋的局域结构,以及数量可观的蛋白质β转角和γ转角的局域结构. 相似文献
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