Analytical potential energy function and spectroscopy parameters for B~1Π state of KH

Multi-reference configuration interaction is used to produce potential energy curves(PECs) for the excited B1Π state of KH molecule.To investigate the correlation effect of core-valence electrons,five schemes are employed which include the different correlated electrons and different active spaces.The PECs are fitted into analytical potential energy functions(APEFs).The spectroscopic parameters,ro-vibrational levels,and transition frequencies are determined based on the APEFs and compared with available experimental and theoretical data.The molecular properties for B1Π obtained in this letter,which are better than those available in literature,can be reproduced with calculations using the suitable correlated electrons and active space of orbitals.     

FKBP12蛋白与其抑制剂结合的分子动力学模拟和结合自由能计算

FKBP12 (FK506-binding protein-12)是一种具有神经保护和促神经再生作用的蛋白. 采用分子动力学模拟取样, 运用MM-GBSA方法计算了FKBP12和3个抑制剂(GPI-1046, 308和107)的绝对结合自由能, GPI-1046的结合能最小, 308小于107的结合能. 通过能量分解的方法考察了FKBP12蛋白的主要残基与抑制剂之间的相互作用和识别, 计算结果表明: 3个抑制剂具有相似的结合模式, Ile56和Tyr82主要表现为氢键作用, Tyr26, Phe46, Val55, Ile56, Trp59, Tyr82, Tyr87和Phe99形成疏水作用区. 计算结果和实验结果吻合.     

MDM2与抑制剂PDIQ作用机制的结合自由能计算研究

p53-MDM2之间的相互作用是抗癌药物设计的重要靶标。采用分子动力学模拟和结合自由能计算研究抑制剂PDIQ与MDM2的结合模式,结果显示范德华作用是二者结合的主体力量。基于残基的自由能分解计算结果表明CH-CH、CH-π和π-π相互作用驱动了二者的结合。这一研究成果可为抗癌药物的设计提供理论上的指导。     

分子动力学研究抑制剂pDI6W与MDM2的相互作用机制

p53-MDM2相互作用已经成为治疗癌症药物设计的重要靶标.本文采用分子动力学模拟和MM-PBSA(molecular mechanics-Possion-Boltzmann surface area)方法计算了肽类抑制剂pD16W与MDM2的结合自由能,结果证明范德华作用是pD16W与MDM2结合的主要力量.相关矩阵的计算结果表明pD16W的结合主要诱导了MDM2内部的反相关运动.基于成对残基的自由能分解计算不仅证明pD16W的5个残基Phe19′,Trp22′,Trp23′,Leu26′和Thr27′能够与MDM2产生较强的相互作用,而且确认了CH-π,CH-CH和π-πc相互作用驱动了pD16W在MDM2疏水裂缝中的结合.这为抗癌药物的设计提供了理论上的指导.     

分子动力学和丙氨酸变异研究MDM2与抑制剂P4的结合模式

抑制p53-MDM2相互作用已经成为癌症治疗的新途径.采用分子动力学模拟和MM-PBSA(molecular mechanics-Possion-Boltzmann surface area)方法研究了肽类抑制剂P4与MDM2的结合模式.研究表明P4与MDMD2疏水性裂缝的范德华作用是抑制剂结合的主导力量。采用丙氨酸变异计算研究了P4与MDM2的作用热区.结果表明残基Lys51,Leu54,Leu57,Ile61,Met62,Tyr67,Gln72,His73,Val93,His96和Ile99的丙氨酸变异导致了范德华作用的降低,而对极性相互作用几乎没有产生影响,同时也证明这些残基处于P4与MDM2作用表面的热区,对抑制剂的结合有重要贡献,这能为抗癌药物的设计提供理论上的指导.     

激光等离子体发射谱展宽机制研究

根据激光诱导Cu等离子体的发射光谱特性,详细地讨论了谱线展宽机制;根据谱线的强度和半高宽度,计算了等离子体的电子温度和密度,给出了电子密度的时间和空间的演化规律。     

多原子分子在金属表面解离吸附的量子动力学研究

利用SVRT模型计算CD4在Ni(100)表面的解离几率随动能的变化关系, 给出对应初始状态(v=1, 2, 3, j=1)和(v=2, j=1, 3, 5)时的计算结果, 画出了解离关系曲线.     

DISTORTED WAVE-WAVE PACKET APPROACH TO VIBRATIONAL DEACTIVATION OF DIATOMIC MOLECULE BY COLLISIONS WITH SOLID SURFACE

A model is proposed for vibrational dexcitation of diatomic molecule by collisions with a solid surface, and used to predict the rotational and translational energy distributions and other properties of interest. It is found that molecular rotation dominates over translation in receiving the vibrational energy released, even for the heavier diatomic molecules.     

离子束注入对聚四氟乙烯表面改性研究

在剂量为1×1014～1×1017 ions/cm2的范围内,用能量为160 keV氮离子对PTFE表面进行注入处理,处理后的样品用可见(514.5nm)和傅立叶红外(1064 nm)喇曼(Raman)光谱以及扫描电镜进行检测.结果表明低剂量注入可导致弱C-C键的断裂,中等剂量时溅射损失效应明显,高剂量注入时微观结构强烈地变化并生成C=C双键.     

Ar+N2体系在长势域上转动非弹性散射的Opacity函数

用一种新的方法研究了Ａ＋ＢＣ体系的转动非弹性散射，即对体系总Ｈａｍｉｌｔｏｎ量中的平动能部分在坐标表象中的显示式用代数方法解析求出，离心势能部分采用ｃｅｎｌｒｉｆｕｇａｌ ｓｕｄｄｅｎ（缩写为ＣＳ）近似，转动能部分采用Ｆｏｕｒｉｅｒ变换处理，并利用二阶差分（ＳＯＤ）法近似含时间的Ｓｃｈｒ?ｄｉｎｇｅｒ方程中的时间偏导，由此得到散射波函数。利用该法对Ａｒ＋Ｎ₂体系的非弹性散射ｏｐａｃｉｔｙ函数做了详细的计算，结果表明，本法比常用的波包（ｃｌｏｓｅ ｃｏｕｐｌｉｎｇ ｗａｖｅ ｐａｃｋｅｔ，缩写为ＣＣＷＰ）法更适合于计算长势域上的高Ｊ（总角动量）值散射，且计算量较后者小。 关键词：