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聚类是芯片数据分析中被广泛使用的方法。未知基因的功能通常通过其与已知基因在不同生物状态下具有表达相似性来进行预测。然而,还未有人就这种通过表达相似性来进行功能注释的方法的可靠性进行评估。本文利用Gene Ontology对表达相似性和基因功能相似性的相关关系进行了全面的研究。研究表明,尽管表达谱的相似性和基因功能相似性之间有一定的依赖关系,但相关性较弱。在Gene Ontology的三大类中,相对生物过程和分子功能,基因表达谱的相似性更有助于细胞组分的注释。本文的研究结果对于基因功能的预测有一定的指导意义。 相似文献
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双层散射介质的单次后向散射光谱分析 总被引:3,自引:4,他引:3
从上皮组织的结构特点出发,基于米氏(Mie)散射理论,建立了双层散射介质的单次后向散射光谱的理论模型,该模型通过偏振门屏蔽来自下层的噪声背景,只保留来自上层的单次散射光。计算分析了粒子的形态学参量如平均尺寸及其分布、相对折射率变化时,单次散射光谱的特征。并用傅里叶波形分析法研究了这些参量对单次后向散射光谱曲线形状及其谐波幅值的影响。结果表明,这些只经历了表层粒子单次散射的光谱信号对表层粒子的平均尺寸及其分布、相对折射率具有灵敏性。对光谱曲线波纹结构的幅值、频率,散射强度,光谱谐波的幅值有直接的影响。研究结果对早期癌症的散射光谱特征识别及其特征提取有重要的实用价值。 相似文献
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Monte Carlo方法已被广泛用于模拟复杂的随机介质如生物组织中光的辐射传输.在生物光子应用中,早期的Monte Carlo模拟模型忽略了光在组织中传输的波动性,而用中性粒子光子包来模拟其传播过程.然而,许多光学诊断技术是基于光在组织中的偏振效应和多重散射的相干性来揭示组织的生理和病理信息,这就要涉及光辐射的波动性.本文阐述了用Monte Carlo方法模拟光在生物组织中传播的最新进展. 相似文献
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微片固体激光器具有体积小、寿命长等优点,是精密测量仪器的重要光源。构建了平-平、半外腔的Nd:YAG和Nd:YVO4微片激光器,通过控制压电陶瓷伸缩改变激光器的谐振腔长,同时使用F-P扫描干涉仪和波长计观察纵模和波长。研究了这2种微片固体激光器的腔调谐特性,包括腔长与光功率的关系,激光纵模扫过出光带宽过程的光功率和单、双纵模变化的规律。实验结果表明:腔调谐过程中单、双纵模交替出现,腔长和泵浦电流共同影响激光器的输出模式和光功率。 相似文献
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发展了一条1,2,6,7-四氢-8H-茚并[5,4-b]呋喃-8-酮的新合成方法,以价廉、易得的对溴苯酚为原料,在无水碳酸钾作用下与2-溴乙醛缩二乙醇缩合后用多聚磷酸(PPA)环合得5-溴苯并呋喃,该中间体与丙烯酸甲酯在Pd(OAc)2催化下,经Heck偶合反应得3-(苯并呋喃-5-基)丙酸甲酯,在氢氧化钠水溶液中经Raney Ni催化氢化和水解一锅反应得3-(2,3-二氢苯并呋喃-5-基)丙酸,再经二溴代、Friedel-Crafts酰化反应和氢解脱溴,得1,2,6,7-四氢-8H-茚并[5,4-b]呋喃-8-酮,7步反应总收率49.9%.该方法原料易得、反应条件温和、操作简便、产物分离纯化容易,收率良好,适合大规模制备1,2,6,7-四氢-8H-茚并[5,4-b]呋喃-8-酮. 相似文献
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利用线性空间的理论,在高观点下给出了多项式带余除法定理的一个新证明.它避免了使用构造法这种技巧性较高的数学方法,使学生比较容易轻松掌握. 相似文献
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建立RP-HPLC法测定西洛多辛固体分散体含量。采用Inertsil ODS-3 C18(4.6mm×250mm,5μm)色谱柱,流动相为乙腈:磷酸盐缓冲液(调pH值为7.0)=50∶50(V/V),检测波长220nm,流速1.0mL/min,柱温30℃。结果表明在25—250μg/mL范围内,西洛多辛线性良好(n=6,r=0.9997),平均回收率104.46%,RSD为2.97%。本方法灵敏,快捷,结果准确,可用于西洛多辛固体分散体的含量测定。 相似文献
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基于氨基酸模糊聚类分析的跨膜区域预测 总被引:2,自引:0,他引:2
跨膜蛋白在进化过程中,序列保守性较差,即使是同源蛋白序列的一致性程度也较低,因而在跨膜区预测算法中,通过序列的一致性程度来选取训练集并不能有效地消除预测结果对训练集的过度适应性.本文提出了一种基于氨基酸模糊聚类分析的预测算法,通过氨基酸在各个区域分布的相似性程度进行模糊聚类,从而根据一类氨基酸的分布特性而不是各个氨基酸的分布特性进行跨膜区预测.结果表明,该方法能在一定程度上消除训练集的选取对测试结果的影响,提高跨膜蛋白拓扑结构预测的准确度,特别是提高对目前知之甚少的跨膜蛋白的预测准确度. 相似文献