分子模拟用于尤文肉瘤EWS-FLI1蛋白HLA-A2.1限制性CTL表位的筛选

为获得尤文肉瘤EWS-FLI1融合蛋白有效的HLA-A2.1限制性CTL表位, 综合运用BIMAS, SYFPEITHI, Predep和IEDB方案对EWS-FLI1进行CTL表位的预测, 得出8个CTL表位9肽序列; 应用多项式方案、量化基序方案对8个表位9肽进一步进行筛选, 获得其中4个9肽序列, 并进一步运用分子模拟方法初步模拟了4个表位肽与HLA-A2.1分子间的相互结合作用; 应用标准Fmoc方案合成CTL表位肽, RP-HPLC与MS分别鉴定合成肽的纯度与分子量; 通过亲和力实验验证了表位肽QIQLWQFLL_{(EWS-FLI1 304)}与HLA-A2.1有较强的结合力, 从而为表位肽的后继免疫学特性研究提供了基础. 本研究提供了一个合理高效的表位筛选方法.     

含磷嘧啶类CDK9抑制剂的分子对接、3D-QSAR和分子动力学模拟

选取64个具有潜力的含磷嘧啶类细胞周期依赖性蛋白激酶(CDK9)小分子抑制剂,采用分子对接方法研究了该类小分子与CDK9的结合作用,结果表明,分子构象、氢键形成、疏水性和氨基酸残基Cys106在此类抑制剂与CDK9的结合过程中具有重要作用.在配体叠合的基础上,运用比较分子力场分析(Co MFA)、比较分子相似性指数分析(Co MSIA)和Topomer Co MFA(T-COMFA)研究了分子结构与抑制活性的关系,发现由训练集立体场、静电场和疏水场组合的Co MSIA模型为最优模型,其内部交叉验证相关系数(Q2=0.557)、非交叉验证相关系数(R2=0.959)和外部预测相关系数(r2=0.863)具有统计学意义,该模型的三维等值线图直观显示了化合物的活性与其三维结构的关系.根据这些结果设计了10个具有新结构的含磷嘧啶类化合物,分子对接和分子动力学模拟结果表明,新化合物和CDK9的结合模式与原化合物64相同,自由能分析从理论上证明了新化合物64d的CDK9抑制活性优于化合物64,并且显示含磷基团与残基Asp109的静电场能在化合物与CDK9作用过程中有重要作用.     

柴油降凝剂的合成及性能研究

合成了新型聚合物型柴油降凝剂,并采用红外光谱对聚合物进行了表征。X射线衍射技术对不同降凝剂的结晶性能分析表明,聚合物的结晶性能差别很大,结晶度不同,蜡晶分散效果不同。同时发现,当两者结晶性能状态匹配时蜡晶分散效果变好,降凝性能最佳,并由柴油体系降凝性能证实。     

Ni2P/TiO2的制备及其对苯加氢反应的催化性能

采用程序升温还原方法制备了TiO2负载的晶态Ni2P催化剂。用X射线衍射（XRD）及低温N2吸附（BET）等技术对样品的物相、比表面积等性质进行了表征。以苯气相加氢为模型反应考察了Ni2P/TiO2催化剂加氢性能，并对Ni2P负载量、前驱体中P的质量分数对催化剂的物相及性能的影响进行了研究。实验结果表明， TiO2负载的晶态磷化镍催化剂上，Ni2P是主要物相。Ni2P/TiO2催化剂对苯加氢反应具有较高的活性、选择性以及良好的稳定性能。Ni2P/TiO2制备对催化剂的性能有影响。Ni2P负载量增加，催化剂的活性先升高后降低，Ni2P负载量为12%时催化剂活性较高。催化剂前驱体中P的质量分数越高，制备出的催化剂对苯加氢反应的稳定性越好，但随前驱体中P的质量分数增加，催化反应的活性先升高，后降低。与Ni2P/SiO2比较，Ni2P/TiO2催化剂具有较高的活性和稳定性。