用界面几何约束的多起点蒙特卡罗方法对蛋白质/ 短肽识别体系的对接计算

提出了一个界面几何约束的多起点蒙特卡罗构象搜索方法,并把这个方法用于三个丝氨酸蛋白酶/短肽抑制剂体系的刚性、部分柔性和全部柔性对接计算中。我们的方法成功地预测出了接近晶体结构的配体构象。与没有几何约束相比,我们的几何约束蒙特卡罗方法显示出了更好的收敛性质。     

确定蛋白质-短肽复合物结构的新方法

大部分蛋白质 -蛋白质复合物的三维结构在接触表面都显示出很好的几何匹配 .由于蛋白质的表面几何形状和其它的一些物理化学性质在分子的专一性相互作用中起了主要作用 ,所以 ,接触表面几何形状的互补常常被认为是蛋白质分子识别的基础 .一般来说 ,蛋白质接触表面的几何匹配只涉及 5到 1 0几个紧密堆积的氨基酸残基 ,因此 ,蛋白质与蛋白质配体之间的识别计算可以通过蛋白质与突变周围的或与蛋白质表面紧密接触的配体肽段的识别计算来实现 . Stoddard等 [1] 已经利用从 MBP上选取的八肽成功地计算出接近晶体结构的 MBP-受体复合物 .许多研…     

一个新的过氧化物酶模拟物的合成及抗白内障活性研究

白内障是当今世界上主要的致盲眼病之一,其患病人数每年呈上升趋势．由于白内障的氧化损伤机理已越来越为人们所认识,各种抗氧化剂类物质已被用于白内障的预防和治疗．然而,目前所有这些药物均未达到令人满意的效果．最近几年酶学活性的抗氧化剂的开发越来越受到重视．由细胞色素C水解得到的微酶MP-8,MP-9和MP-11是较好的过氧化物酶模拟物,在眼晶状体白内障模型中验证了其抗白内障作用．但该化合物不易制备,体内易降解,需要更好的模拟酶用于抗白内障药物开发和形成机理研究．     

具积分边值条件的迁移方程的性质

在L~1空间上研究了一类增生的细菌群体中具积分边界条件的迁移方程.得出迁移算子是预解正算子,微分算子的共轭算子及共轭算子的定义域.证明了迁移算子的共轭算子定义域的正锥在共轭空间的正锥中共尾.最后证明了迁移算子的增长界等于其谱界.     

纤维素基聚合物液晶溶液的发展、现状及展望

使用液晶溶液纺丝可以制得高强度、高模量的纤维.经大量研究发现,作为环保可再生的资源,纤维素及其衍生物在一定浓度和一部分合适的溶剂体系中能够形成各向异性溶液.但目前,纤维素基聚合物的液晶溶液纺丝并没有成功实现工业化.文章综述了纤维素基聚合物的液晶理论,其液晶溶液的发展过程与现状及独特的流变行为,并展望在少数能直接溶解纤维素并形成液晶溶液的溶剂体系中,磷酸是一种合适的溶剂体系,有很大的发展和应用空间.     

小肽免疫抑制剂的活性研究

用标准的Fmoc保护氨基酸N^α氨基的固相法合成了6肽Ac-XCSSXX-NM2(-CSS-为保守序列，该设计合成的6肽是从若干单克隆中挑选出与IL－2结合力最高的），经HPLC纯化，并通过MS检测。分别以ConA诱导的淋巴细胞转化实验和IL－2诱导的淋巴母细胞转化实验为体外模型，以大鼠肝脏移植为体内模型，观察小肽对移植排斥的影响。在ConA诱导的淋转实验中，加入小肽（250－31.25μg/mL）对淋转反应有明显的抑制作用（P＜＜0.01），在终浓度为31.25μg/mL时，抑制率达到最高。IL－2诱导的淋转实验得到与上述相符的结果，从而进一步表明：小肽是通过抑制IL－2和IL－2R的结合从而实现其免疫抑制作用的。在大鼠肝脏移植模型中：给术后大鼠注射小肽共5d（10mg/kg）可明显延长进行肝移植后大鼠的存活时间。     

Exendin-4类似物的生物活性及结构

针对Exendin-4的N端螺旋中第10~18位氨基酸序列LSKQMEEEA设计了Ex1, Ex2序列, 并进行活性、稳定性及其结构方面的研究, 为进一步设计具有Exendin-4活性的短肽抗酶解序列提供了理论依据, 进而为开发可供口服的类肽糖尿病药物奠定了结构理论基础.     

QDs标记免疫调节肽及其与T细胞作用的表征

量子点是直径为1~10 nm的球形半导体纳米晶体, 也被称为半导体量子点, 简称QDs. 与有机荧光染料相比, QDs具有激发光谱单一、 荧光谱线窄、 发光效率高、 发光颜色可调、 可进行多色联合标记, 并且光稳定性好等优点, 所以量子点是非常有前途的生物标记物[1,2].  研究结果表明, 量子点可以与许多生物分子如蛋白质、多肽、核酸及小分子配体等偶联. 现已有许多关于量子点标记生物分子的报道, 如用量子点标记木瓜蛋白酶、 胰蛋白酶、 天花粉蛋白和表皮生长因子等[3-5].用量子点标记生物分子作为荧光探针已成功地应用于多种生物分析, 如DNA杂交监测、 免疫分析和用QDs检测ATP推动的反应等[4,6,7]. 目前, 对量子点标记生物分子的报道多为对大分子蛋白质的标记, 而对小分子肽标记的报道却很少.     

量子点的荧光共振能量转移在生物分析中的应用

量子点良好的光谱特性和自身优点,使其可以作为生物荧光探针,而替代传统荧光染料。近年来这方面的研究已经取得了一定的进展。目前,量子点在共振能量转移方面的研究,进一步扩展了它在生物分析中的应用。介绍了量子点基于共振能量转移原理在生物分析中的应用,即利用量子点设计的两种类的蛋白-蛋白特异性结合分析和3种生物传感器的模型设计。     

建立短肽抑制剂与酶识别的模式--基于表面静电互补和溶剂化能的Docking计算方法

提出了把简化的接触表面静电互补模型电互补模型与溶剂化能模型相结合的新的Ｄｏｃｋｉｎｇ计算方法,编写了计算模拟程序ＥＳＣＯＬＤ,并用于酶－短肽体系的Ｄｏｃｋｉｎｇ计算,对３个已知Ｘ射线晶体结构的酶－抑制剂肽链复合物中的六太用ＥＳＣＯＬＤ重新进行了Ｄｏｃｋｉｎｇ计算,用溶剂化能作为评价函数,正确地预测出接近实验结果的六肽取向。