两类非甾类终止妊娠药物代谢影响因素理论化学研究

采用半经验AM1量子化学方法计算了两类非甾类终止妊娠化合物的物理化学参数,并用多元线性回归分析法对所研究化合物的代谢强度进行QSAR研究,得到了较好的结果.两个模型互相验证,结果一致,有较高的预测能力.根据所建立的模型,化合物较高的生成热以及主要代谢位置上的前沿电子密度均为代谢的不利因素,这可能与化合物体内代谢历程有关.     

化合物分子体积计算方法的研究

本文提出了一种计算化合物分子体积的有效方法，在确定化合物分子构象的基础上，将随机变量的统计方法引入计算体系，可以计算出化合物任一构象条件下的分子体积．比较计算结果可知，我们的方法与同类其他计算方法同等精确，但算法的简捷、快速显得更为优越．在将我们的方法计算的化合物的分子体积用于化合物的结构一性质相关性研究时发现，分子体积能较好地表征化合物的结构特征．     

谷胱甘肽分子伞的构象分析及VolSurf表征

使用分子动力学模拟迟火和半经验AMl方法对谷胱甘肽分子伞进行了构象分析 ，结果表明，真空下屏蔽构象和暴露构象的最低能量值相差很小(26.00kJ/mol)。 考虑溶剂效应后，屏蔽构象的能量值最高，暴露构象的能量值最低。屏蔽构象的能 量最低值高于暴露构象的能量最低值89.24kJ/mol，从理论上解释了谷胱甘肽分子 伞在水溶液中呈现暴露构象的原因。利用VolSurf参数分析了分子伞以屏蔽构象穿 透磷脂双分子层的影响因素，结果表明屏蔽构象较小的两亲矩及较大的分子褶皱程 度是其能够穿透细胞膜的主要影响因素，与构象的绝对疏水区域无关。     

QSAR Study and VolSurf Characterization of Human Intestinal Absorption of Druge

The prediction of human intestinal absorption is a major goal in the design,optimization,and selection of candidates for the develoment of oral drugs.In this study,a computerized method(VolSurf with GRID) was used as a novel tool for predicting human intestinal absorption of test compound,and for determining the critical molecular properties needed for human intestinal absorption.The tested molecules consisted of 20 diverse drug-like compounds.Partial least squares(PLS) discriminant analysis was used to correlate the experimental data with the theoretical molecular properties of human intestinal absorption.A good correlation(r^2=0.95,q^2=0.86) between the molecular modeling results and the experimental data demonstrated that human intestinal absorption could be predicted from the three-dimensional(3D) molecular structure of a compound .Favorable structureal properties identified for the potent intestinal absorption of drugs included strong imbalance between the center of mass of a molecule and the barycentre of its hydrophilic and hydrophobic regions and a definitive hydrophobic region as well as less hydrogen bonding donors and acceptors in the molecule.     

5-芳基乙内酰脲类化合物QSERR研究

用多元线性回归分析对50个在Pirkle型手性固定相色谱柱上手性拆分的乙内酰脲类化合物进行了QSRR（quantitative structure-rentention relationship）和QSERR（ quantitative-structure enantioselective rentention relationship）研究 .所选的2D和3D描述参数由分子力学和量子化学计算得到.回归结果表明,R和S异构体与识别剂的相互作用的确存在差异.这些方程不仅有助于推测被识别剂和识别剂之间的结合方式,还可以定量的预测结构相近的类似物的拆分可能性,为设计合成新的识别剂和被识别剂都提供了一定的理论依据.     

多氯联苯的定量结构－性质(活性)关系

多氯联苯(PCBs)是一类重要的持久性环境污染物.首先对所有209个PCB分子进行了HF/6-31G*水平上的结构优化, 在优化结构上获得了分子的表面静电势分布, 并在此基础上对其统计导出的参数进行了计算．其后, 运用多元线性回归方法对PCBs的水溶性、正辛醇/水分配系数、正辛醇/空气分配系数、土壤吸附性、水溶液活度系数、298 K超冷流体蒸汽压、总分子表面积、色谱保留指数、升华焓、蒸发焓、熔融焓、PCB结合芳烃受体活性数据、生物降解度以及生物降解速率参数等理化性质和生物活性与分子的结构参数进行了关联．结果表明:分子静电势参数结合分子表面积和常规的量子化学参数可以很好地用于表达多氯联苯分子理化性质和生物活性与其分子结构间的定量关系．     

离子液体中有机物溶解度的QSPR模型分析

采用偏最小二乘(PLS)分析方法对84个有机物在四种不同的离子液体中的溶解度进行基于VolSurf参数的定量构性关系(QSPR)研究,取得较好的结果.训练集模型对预测集具有良好的预测能力.参数分析表明有机物具有较大体积的亲水区域,对溶解度有利,且有机物与离子液体之间的相互作用能约为-0.84kJ·mol-1.一定的疏水性对溶解度也是有利因素,当离子液体具有小体积的疏水取代基,有机物具有不对称的局部疏水区域对溶解度有利,当离子液体具有大体积或多个疏水取代基,有机物较高的疏水体积对溶解度有利.多元线性回归(MLR)显示亲水参数W1最重要,表明分子的亲水性是影响有机物在离子液体中溶解的关键因素.     

CDK4与靛玉红及其衍生物复合物结构的模建

细胞周期蛋白依赖性激酶(Cyclin-dependent Kinases, CDKs)是细胞周期调控的重要因子, 也是治疗癌症的一类重要的药物靶标. 靛玉红是传统中药当归龙荟丸中治疗慢性疾病的有效成分, 靛玉红及其衍生物5-磺酸基-靛玉红对CDKs具有有效的抑制作用. 以获得晶体结构的CDK2与5-磺酸根-靛玉红的复合物为模板, 通过同源模建和分子对接的方法构建出的CDK4与靛玉红及其衍生物的结合模式. 结合CDK4与两种抑制剂的复合物结构, 解释了靛玉红和衍生物5-磺酸基-靛玉红之间抑制活性的差别, 同时也分析了5-磺酸基-靛玉红对CDK2和CDK4不同选择性的原因. 所建CDK4结构为进一步进行基于结构的抗癌药物设计提供了合理的模型.     

吡咯喹啉醌模型化合物与氨亲核加成的理论探讨

为了揭示辅酶PQQ结构与反应性的关系,在B3LYP/D95(d, p)水平上对一系列PQQ模型化合物及其类似物与氨的亲核加成进行了理论计算.结果表明:对单羰基体系,羰基碳的亲电性对反应能垒有重要的影响;对双羰基体系,过渡态中邻位羰基氧与亲核试剂氨上的H形成的氢键对反应的活化能起着关键的作用;稠合芳香环本身对反应的能垒影响不大,但当稠合杂环的1-位为可提供氢键受体的N原子时,由于N1与氨上H原子间可形成氢键而进一步降低反应的活化能.发现过渡态中被进攻羰基与氨上N原子之间形成的夹角(OCN)与活化能有良好的线性关系.     

分子伞辅助药物输送

随着新药的不断开发,药物在生物体内的吸收、分布、代谢、排泄和毒性（ADME／T）等性质已经引起了人们的高度重视。寻找合适的药物载体提高药物分子的水溶解度、稳定性和膜渗透能力从而进一步提高药物在生物体内的吸收,已经成为药物设计开发的一个新领域。近年来,分子伞作为一种新的药物载体被报道,本文介绍了其研究概况。