基于结构的O-GlcNAc转移酶抑制剂的虚拟筛选

利用O-GlcNAc 转移酶同UDP-GlcNAc复合物的晶体结构,针对其催化位点,对ZINC库中的7134792个分子和FOG库中的4287550个分子进行三轮(HTVS、SP、XP)虚拟筛选,结果发现具有更好类药性的FOG库中包含更多对接得分更低的小分子,且具有更多新颖的化学片段.ZINC库中具有较低对接得分的分子可分为2类,分别占据UDP-GlcNAc的UDP和GlcNAc的结合位置,在此基础上设计得到的分子具有更好的对接得分.证明FOG分子库具有产生更多对接得分更低的分子,所预测和设计的小分子化合物可以成为潜在的抑制剂药物分子.     

A2B嵌段共聚物熔体的相分离

采用自洽场的方法对A2B共聚物熔体作了类似星形共聚物的处理，研究了该共聚物的相分离并给出了相图．与两嵌段共聚物的相图相比较而言，在A2B的相图中，只发现了三个经典的有序相：球状相、六角蜂窝形柱状相以及层状相．从两嵌段线形共聚物到Y形共聚物这一链结构上的变化使相图也发生了相应的改变：各相的相边界发生了很大的偏移并且层状相出现的区域被大大的拓宽了．因此，可以通过改变链的结构来控制高分子自组装的微相结构，从而代替传统的改变高分子链中各组分的比例．     

聚甲基丙烯酸甲酯与苯乙烯-丙烯腈共聚物混合体系相分离初期的固体NMR研究

本文用氢谱宽线固体NMR技术研究了聚甲基丙烯酸甲酯(PMMA)和苯乙烯-丙烯腈共聚物(SAN)混合体系不稳相分离初期阶段,得到了在分相过程中弛豫谱的变化规律,测定了相分离增长速率。结果指出:随着退火时间的增加,两相体系形成;大分子扩散方式是由浓度低的区域向浓度高的区域扩散,扩散系数为负值;相分离增长速率的数量级与用光散射研究的结果相同;分子相互作用的相关距离为46.5nm。     

流场驱动高分子链迁移穿过微通道的耗散粒子动力学模拟

利用耗散粒子动力学模拟方法研究了高分子链在流场驱动作用下迁移穿过微通道过程中的链构象变化和动力学行为.在足够大的流场力驱动作用下,高分子链在沿着流场方向逐渐被拉伸,从而能够穿过管径小于其自身尺寸的微通道.耗散粒子动力学模拟结果表明高分子链的迁移过程主要分为3个步骤:(1)在流场驱动作用下,高分子链漂移并逐渐靠近微通道入口;(2)高分子链逐渐调整自身构象,并使其部分进入微通道;(3)高分子链成功穿过微通道.同时,模拟还发现当高分子链尺寸大于微通道细管道管径时,高分子链穿过微通道所需的平均迁移时间随着流量的增加而逐渐减小.此外,为了研究高分子链刚性对高分子链穿过微通道的影响,模型中还引入了蠕虫状高分子链模型.模拟结果发现,高分子链的链刚性越强,其迁移穿过微通道的时间越长.     

最有效的相容剂是两嵌段还是多嵌段聚合物?

Monte Carlo simulations were used to investigate the compatibilizing behaviors of multi-block copolymers with different architectures in A/B/(block copolymer) ternary blends. The volume fraction of homopolymer A, employed as the dispersed phase, was 19%. The simulations illustrate how a di- or multi-block copolymer aggregates at the interfaces and influences the phase behaviour of such incompatible polymer blends. The di-block copolymer chains tend to "stand" on the interface whereas the multi-block chains lie on the interface.In comparison with the dj-block copolymer, the block copolymers with 4, or 10 blocks can occupy more areas on the interface, and thus the multi-block copolymers have higher efficiency for the retardation of the phase separation.     

聚电解质混合物在均匀带电平面上吸附的密度泛函研究

采用非局域密度泛函理论计算方法(NLDFT), 我们研究了两种带相反电荷的聚电解质混合物在均匀带电平面上的吸附以及吸附层的电荷反转现象. 我们对表面带电密度和聚电解质链段的价态对吸附的影响做了系统研究, 发现在体系中不含小离子的情况下, 当体系中两种聚电解质链段都为单价时, 和表面带相反电荷的聚电解质链能够吸附在平面上, 而和表面带相同电荷的聚电解质链和表面之间相互排斥, 整个过程就是表面电荷被与之带相反电荷的聚电解质链上所带电荷中和的过程, 没有出现明显的电荷反转现象|当体系中作为反离子存在的聚电解质链段价态为二价时, 和表面带相同电荷的聚电解质链能在表面上吸附, 出现明显的电荷反转现象. 理论研究表明, 以反离子居中为媒介的静电相关效应是聚电解质混合物出现多层吸附的主要驱动力之一.     

缩短shRNA的3′尾与靶标mRNA的配对降低脱靶效应

基于对microRNA和短发夹RNA(shRNA)的3′尾功能的理解，提出了一种仅通过缩短shRNA的3′尾与靶标序列的互补长度来降低脱靶效应的方法。此方法可以在不损伤shRNA基因沉默效率的前提下达到降低shRNA脱靶效应的目的，从而有效提高shRNA的基因沉默特异性。此策略不受反义链3′区域序列的限制，可以显著改进RNA干扰设计的规则，一定程度上简化shRNA药物设计中的序列限制，拓宽其作为治疗和诊断工具在医疗中的用途和前景。     

Factors Affecting Polymer Translocation Through a Nanopore in a Membrane

采用Monte Carlo方法研究了高分子链穿越"trans"侧具有吸附作用的膜上纳米孔的过程. 当体系的温度TTc时,τ随着温度的升高而增大. 穿孔时间与膜的吸附势强度μ0 之间存在非单调依赖关系,τ首先随着μ0的增大而增大,最后τ随着μ0 的增大而减小. 研究穿孔时间与溶剂性质的关系时发现,当εAB<εc时,τ随着εAB 的增加而增加,当εAB>εc时,τ 随着"AB 的增加而减小. 高分子链穿孔时间与链长N之间存在着标度关系：当吸附势强度μ0>μc时,τ∝N^1.602,当μ0相似文献   

耗散粒子动力学研究双层膜线张力与抗弯刚度的关系

利用耗散力粒子动力学模拟方法研究了拉伸状态下双层膜的抗弯刚度与膜孔线张力之间的关系.通过对双层膜在不同投影面积约束下的系统模拟,观察到3个区域:自由振动膜、伸展膜和穿孔膜.由前两个区域的应力张量计算得到的膜的面张力(σΣ)与拟合膜波动性质得到的面张力(σfluc)吻合的很好,除去在两区域的转变点附近σfluc略大于σΣ.当考虑在经典Helfrich弹性膜模型中被忽略的膜厚度时,线张力可以和抗弯刚度用一个简单的模型联系起来.通过对穿孔膜区域的数据进行分析,证明由本模型得到的抗弯刚度与拟合膜波动性质得到的抗弯刚度符合的很好.由此提出一种简便的测量方法,通过计算拉伸膜孔的面张力和统计膜厚度,拟合这个简单模型来测量膜的抗弯刚度.