咪唑啉酮类除草剂的三维构效关系研究

从三维角度出发,采取不同的构象搜索方法得到了咪唑酮类化合物分子的活性构象。利用比较分子场分析方法进一步证实了模板分子构象的正确性。并从静电场、立体场及活性关系等方面进行了三维定量构效关系研究,得到了具有较强预测能力的QSAR模型。     

距离比较法(DISCO)构建原卟啉原氧化酶抑制剂药效团模型

在原卟啉原氧化酶(Protox)三维结构未知情况下,利用距离比较法(DISCO),将8个具有代表性结构特征的Protox抑制剂,与其作用底物(基质)原卟啉原IX(ProtogenIX)的分子构象进行迭合,建立了可能的药效团模型;并据此确定了ProtogenIX与Protox相互作用时,可能采取的活性构象。这些信息将有助于设计、开发新型Protox抑制剂。     

一个取代的三环1,5-苯并二氮杂(艹卓)的晶体结构和构象分析.Ⅱ

用单晶X射线衍射方法测定了6-苯甲酰基-5-(邻氯苯基)-2,3,3a,4,5,6-六氢-3a-苯基-(1,2,3-三乙酸乙酯基)-1H-吡咯啉[1,2-a][1,5-]苯并二氮杂(艹卓)的晶体结构.单斜晶系,空间群P21/c,a=1.3235(5)nm,b=1.7142(6)nm,c=1.6204(6)nm,β=100.49(3)埃琙=4,最终偏离因子R=0.062,Rw=0.075.晶体结构测定结果表明分子中二氮杂(艹卓)七元环采取船式构象,动力学模拟退火计算结果的最低能量构象为椅式,两者的能量差不大,表明这种船式←→椅式的变化是非常容易发生的.     

哥纳三醇类似物抗A2780肿瘤细胞活性及三维定量构效关系研究

以合成的54个哥纳三醇类似物为研究对象, 测试了其体外抑制肿瘤A2780细胞株的活性, 对其中的37个化合物用比较分子力场(CoMFA)研究了哥纳三醇类似物结构与抑制A2780肿瘤细胞活性的三维定量构效关系, 提出了对哥纳香醇甲结构改造的方法, 对寻找更好活性的化合物有重要的指导意义     

4-双(1-苯基-3-甲基-4-吡唑啉-5-酮)甲烷的晶体结构

杂环化合物1 苯基 3 甲基 4 吡唑啉 5 酮(ＨＰＭＰ)为β 二酮,不仅可用作金属离子的萃取剂,还可用于核磁共振的位移试剂,也可用于激光、催化、生化、医学等领域[1-4]。我们从ＰＭＰ出发,合成了它的Ｃｏ(Ⅱ),Ｎｉ(Ⅱ),Ｃｕ(Ⅱ)和Ｚｎ(Ⅱ)的络合物[5,6]。利用单晶Ｘ 射线衍射分析方法报道了标题化合物的晶体结构。1　实验部分在合成ＰＭＰ席夫碱化合物的过程中,得到标题化合物的单晶体。元素分析结果(括号内为计算值)Ｃ%:69 87(69 98),Ｈ%:5 62(5 59),Ｎ:15 61(15 55)。红外光谱(ＫＢｒ):1645和1637ｃｍ-1的强吸收峰归属为羰基的伸缩振动,…     

DISCO法构建ALS抑制剂与受体作用的药效团模型

在受体ＡＬＳ三维结构未知的情况下,利用距离比较法（ＤＩＳＣＯ）对四个结构特征判别较大的ＡＬＳ抑制型除草剂进行了研究,构建了该类除草剂与受体作用的可能的药效团模型,为进一步设计开发新型的ＡＬＳ抑制剂及模拟靶蛋白的活性空腔提供有意义的参考。     

一个取代的三环1,5-苯并二氮杂卓的晶体结构和构 象分析2

用单晶X射线衍射方法测定了6-苯甲酰基-5-(邻氯苯基)-2,3,3a,4,5,6-六氢-3a-苯基-(1,2,3-三乙酸乙酯基)-1H-吡咯啉[1,2-a][1,5-]苯并二氮杂卓的晶体结构。单斜晶系,空间群P2~1/c,a=1.3235(5)nm,b=1.7142(6)nm,c=1.6204(6)nm,β=100.49(3)°,Z=4,最终偏离因子R=0.062,R~w=0.075。晶体结构测定结果表明分子中二氮杂卓七元环采取船式构象,动力学模拟退火计算结果的最低能量构象为椅式,两者的能量差不大,表明这种船式<－>椅式的变化是非常容易发生的。     

苯二酰异羟肟酸及癸二酰异羟肟酸的合成和抑菌活性

苯二酰异羟肟酸及癸二酰异羟肟酸的合成和抑菌活性;大肠杆菌;金黄色葡萄球菌     

PMBP缩间氯苯胺合钴(Ⅱ)的合成、结构和抑菌活性

PMBP缩间氯苯胺合钴(Ⅱ)的合成、结构和抑菌活性;席夫碱;Co配合物;晶体结构     

Building the Pharmacophore Model of HIV-1 Integrase Strand Transfer Inhibitors and Studying Their Inhibition Mechanism

The replication of HIV-1 requires the integration of its cyclic DNA into host DNA by HIV-1 integrase (IN), which includes two important reactions, 3'-processing and strand transfer, both catalyzed by HIV-1 IN. Disrupting either of the reactions will fulfill the purpose of inhibiting the replication of HIV-1. In this paper, pharmacophore modeling and molecular docking are employed to investigate the inhibition mechanism of the HIV-1 IN strand transfer inhibitors (INSTIs). Based on the results, we suggest that the inhibition mechanism of INSTIs involves the inhibitor chelating the cofactors Mg2+ and its forming hydrogen bonds with some crucial residues adjacent to the DDE active center.