基于疏水性小波分析的膜蛋白结构预测

膜蛋白在细胞膜上具有重要的生理功能,大部分膜蛋白在药物设计、转运蛋白和免疫识别等方面起着关键的作用,从分子水平上预测这类蛋白质的结构具有非常重要的意义.本文提出一种基于氨基酸疏水性小波变换技术预测膜蛋白跨膜区段数目和位置的新方法.以代码为upkb-bovin的膜蛋白为例,对跨膜螺旋区数目和位置的预测分析进行了描述.从膜蛋白数据库中随机抽取36个蛋白质(含跨膜螺旋区232)作为测试集检验小波分析的预测方法,其中226个跨膜螺旋区能被准确预测,准确率为96.8%.结果表明,这种预测方法具有较高的预测准确性.     

“2006广东省分析化学发展研讨会”会议纪要

由中山大学化学与化学工程学院举办的“2006广东省分析化学发展研讨会”于2006年7月7—8日在中山大学召开。国家自然科学基金委员会化学部分析化学学科主任庄乾坤教授、北京大学化学系刘虎威教授、清华大学化学系林金明教授和张新荣教授、中科院化学所陈义教授和毛兰群教授应邀出席本次研讨会。中山大学化学学院分析科学研究所所长李攻科教授主持了开幕式，中山大学副校长许家瑞，国家基金委庄乾坤教授、中山大学化学学院院长陈小明教授分别致辞。出席开幕式的领导和嘉宾还有中山大学科技处夏亮辉处长、化学学院党委书记黄乐览研究员、中山大学分析化学博士生导师张展霞教授，来自全省20所高等院校、科研单位和质检部门的分析化学工作者100余人参加了本次研讨会。     

溶胶-凝胶-HBsAb膜免疫传感器的研制与应用

采用溶胶-凝胶(Sol-gel)技术,成功地将乙肝表面抗体(HBsAb)包埋于Sol-gel中,再滴涂于铂盘电极表面,制成溶胶-凝胶-HBsAb膜非标记免疫传感器.根据抗原与抗体特异性结合形成的免疫复合物使敏感膜有效扩散截面积减小的特性,提出了利用铁氰化钾作为氧化还原探针间接检测乙肝表面抗原(HBsAg)的新方法.用循环伏安法(CV)对电极逐层修饰过程进行了表征,并探讨了对HBsAg定量检测的可行性及其响应机理.采用差示脉冲伏安法(DPV)检测人体血清中的HBsAg.线性范围5～320μg/L,线性相关系数r=0.997.该传感器响应迅速,灵敏度高,稳定性好.于4℃干态保存14d,其响应信号基本不变.将其用于108例临床血清检验,与酶联免疫吸附法(ELISA)的符合率为87.5％.     

双通道毛细管电泳-电化学法同时检测硝酸根、亚硝酸根和氯酚类化合物

双通道毛细管电泳-电化学法同时检测硝酸根、亚硝酸根和氯酚类化合物;双通道毛细管电泳电化学法;硝酸根;亚硝酸根;氯酚     

膜蛋白跨膜区段的预测分析

将连续小波变换技术的时频局部化特点和氨基酸的疏水特性相结合,提出了一种用于预测膜蛋白跨膜区段数目和位置的新方法,以代码为1YST的膜蛋白为例,对小波尺度和疏水值的种类进行了选择,同时描述了该法对跨膜螺旋区数目和位置的预测分析过程.从膜蛋白数据库中随机抽取36个蛋白质(含跨膜螺旋区232)作为测试集,采用该方法对其跨膜螺旋区进行预测,其中222个跨膜螺旋区能被准确预测,准确率为96.1%.结果表明,该法具有较高的预测准确性.     

基于分形理论分辨重叠峰的新算法

将分形理论用于仪器分析信号的解析,提出一种面向分析谱图中重叠信号处理的分形分辨算法.通过对信号进行分形分析,采用分形维数可有效地反映信号的特征,准确地得到谱峰个数和位置的信息,避免人为判断的误差,实现重叠复合信号的分辨.实验表明,这种新的重叠谱峰分辨法能用于光谱、电化学、色谱等仪器分析数据的处理     

毛细管电泳微机化扫描伏安检测器

描述了一种毛细管电泳微机化扫描伏安检测器,用微机通过D/A和A/D转换器控制扫描电压和采集电流信号,用12bit的D/A转换器和12bit的A/D转换器通过伏安仪分别与Ag/AgCl参比电极和工作电极相连,进行电位控制和数据采集.讨论了扫描电位的产生和数据采集的控制方法,并用本系统分离测定了对苯二酚和儿茶酚,结果令人满意.     

阶跃伏安法信号的样条小波分析

采用样条小波基处理低信噪比的阶跃伏安法离散数据。仿真实验和化学实验结果表明,样条小波分析含强白噪声的信号时,能保真地提取出有用信号,信噪比(S/N)降低至0.1～0.2.这种方法具有不需设置目标函数、窗口函数、初值估计等优点,同时运算简单、节省储存空间。因此,样条小波运用于信号分析较现行方法优越,并具有广阔的应用前景。     

基于DNA “Y”型结构的指数型核酸恒温扩增策略检测microRNA

该文基于“Y”型DNA模板和恒温指数扩增反应(EXPAR)技术的信号放大功能,建立了一种快速低序列依赖性的miRNA检测方法(Y-EXPAR)。以let-7b为检测目标,设计两条部分互补的DNA模板,与目标miRNA共同构成“Y”型结构,能够同时进行双向扩增,反应效率高,反应时间短,并降低了放大性能对模板序列的依赖。方法检出限低至0.3 amol/L(相当于10 μL溶液中有1.8拷贝的let-7b),并能区分单碱基差异的let-7家族同源序列。应用于肿瘤细胞裂解液let-7b的检测,POI值与细胞数目对数值呈线性关系,说明Y-EXPAR在实际样品miRNA的检测中具有优势。得益于扩增的高特异性、抗干扰性和低序列依赖性,该方法为miRNA的快速检测提供了新思路,在miRNA相关的疾病研究和临床诊断方面具有良好应用前景。     

高效液相色谱内标法测定鸡肉中己烯雌酚残留量

采用高效液相色谱法,以对羟基苯甲酸丁酯作为内标,定量测定了鸡肉中己烯雌酚的含量.色谱柱为C18柱,0.02mol/L三乙胺水溶液(加磷酸调pH=3.0)-乙腈(ⅥV=55/45)作为流动相,采用等度洗脱,检测波长为240nm.结果显示,己烯雌酚的线性范围为0.324～1.30μg/mL,相关系数为0.9998,用浓度为0.648μg/mL的标准溶液重复进样6次,其相对标准偏差(RSD)为1.28%.方法简便准确,适于鸡肉组织中违禁药物己烯雌酚含量的测定.