辐射阻尼引起二维核磁共振NOESY谱中的伪信号

讨论水溶液样品ＮＯＥＳＹ谱ω₁维上出现的谐波，用辐射阻尼线形理论对实验进行了分析，证明了这些谐波是由辐射阻尼造成的伪信号．同时分析了这种伪信号在不同混合时间时的线形特征，与实验结果符合相当好，给出了实验上消除这种伪信号的方法 关键词：     

全原子分子动力学模拟结合核磁共振波谱研究N-甘氨酰甘氨酸水溶液的结构和弱相互作用

采用分子动力学模拟方法结合核磁共振化学位移系统研究了甘氨酰甘氨酸水溶液体系饱和溶解度范围的弱相互作用. 径向分布函数表明体系中不同类型的原子显示出形成氢键的不同能力. 氢键网络分析发现了不同氢键所能形成的分子簇结构. 随温度变化核磁共振化学位移值用于研究形成氢键的变化情况,并和模拟得到的结果进行比较,模拟和实验结果得到了较好的吻合.     

全原子分子动力学模拟研究丙氨酸二肽水溶液的结构和氢键作用

采用全原子分子动力学模拟研究了丙氨酸二肽分子在水溶液中的结构和氢键作用。径向分布函数和氢键统计用于分子动力学模拟的分析。从径向分布函数（RDF）发现不同类型的强氢键显示出不同的形成能力,而体系中的C−H•••O弱相互作用较为明显,也不能忽略。氢键统计分析的结果也证实了这一点。分子内距离、回转半径和骨架二面角用于表征丙氨酸二肽分子在水溶液中的构象变化。丙氨酸二肽分子在水溶液中的柔顺性较好,构象在折叠和伸展之间相互转换。     

MRI定域二维谱

定域谱和二维谱技术都是NMR的重要研究手段.定域二维谱,就是将二者结合,同时具有空间信息和二维谱的诸多优点.本文利用STEAM脉冲序列加以改造,完成了三维空间定域的二维¹H-¹H NOESY实验.     

NOESY在立体化学研究中的某些应用

应用二维NOESY技术,对同分异构体1-4、顺反异构体5、6及两个环丙烷衍生物7、8在溶液中的构型、构象等立体化学问题进行了研究,并对化合物5-8进行了计算机分子模拟,取得与NOESY一致的结果.     

胰岛素类似物氨基酸残基质子自旋体系的二维谱模拟

以MARS程序对胰岛素类似物的残基质子自旋体系作计算机模拟,由模拟谱与B链C端去五肽胰岛素、S-磺酸型胰岛素A、B链的二维相关谱的比较,表明模拟谱与实测谱交叉峰图形及精细结构十分相似,验证了实测谱所作残基质子自旋体系的鉴别,同时也表明此程序可广泛应用于蛋白质等生物分子的二维谱模拟。     

中国人参的核磁共振研究Ⅰ．人参皂甙Re的二维核磁共振谱研究

用４００ＭＨｚ和５００ＭＨｚ超导核磁共振谱仪测定了具有生理活性的达玛烷型人参皂甙Ｒｅ的同核、异核二维化学位移相关谱和相敏双量子滤波二维相关谱，由此归属了人参皂甙Ｒｅ的氢谱，测定了Ｒｅ的质子偶合常数。     

在二维原子自洽场计算中的Gaussian函数展开方法

报告了在二维原子结构的自洽场计算中,单电子波函数向笛卡尔Gaussian函数展开的基本方法.推导了由s,p和d电子组成的闭壳层和开壳层电子组态的能量表达式,和二维的Hartree-Fock-Roothaan HFR方程,最后给出了二维原子自洽场计算的主要结果精度的讨论.     

核磁共振二维谱反演

核磁共振二维谱包含扩散系数 D 和横向弛豫时间 T₂ 的信息,利用核磁共振仪来测量多孔介质中物质的信息,根据其弛豫时间和扩散系数的差别来区分不同物质;利用全局反演方法,提出了核磁共振二维谱反演的物理模型和数学模型;介绍了传统的奇异值分解（SVD）和改进的奇异值分解反演算法;采用改进的奇异值分解法对核磁共振二维谱进行反演,其反演算法具有计算速度快和二维谱分布连续等优点. 它适合于信噪比较高的数据反演,当原始数据信噪比SNR≥100时,可以对二维谱图进行定量分析;当60≤SNR<100时,可以对二维谱图进行定性分析. 核磁共振二维谱可以一次性直接区分油和水,为核磁共振测井提供了新的科学技术.     

分子动力学模拟研究DMSO-水体系的结构和相互作用

用分子动力学模拟方法结合核磁共振化学位移和红外光谱结果,研究二甲基亚砜DMSO水溶液在全浓度范围内的结构和弱相互作用. 表明径向分布函数分析,DMSO水溶液中既存在着传统的强氢键又存在C—H…O弱相互作用. 氢键网络分析发现DMSO水溶液体系在水富集区域,水分子倾向于自身缔合形成稳定的分子簇结构,而随着DMSO浓度的逐渐增加,水的有序结构受到破坏. DMSO的摩尔分数为0.35是一个特殊点,多种性质偏离理想混合最远. 水分子和DMSO分子发生了交叉缔合作用形成稳定的分子聚集体. 分子动力学统计的平均氢键数与核磁共振化学位移和红外波数变化数据结果进行比较,结果吻合很好.     

All-atom Molecular Dynamic Simulations and NMR Spectra Study on Intermolecular Interactionsof N,N-dimethylacetamide-Water System

采用分子动力学模拟方法结合核磁共振化学位移系统研究了N,N-二甲基乙酰胺(DMA)水溶液体系全浓度范围的弱相互作用. 并对动力学模拟结果和核磁共振化学位移进行了比较. 径向分布函数表明体系中强氢键和C-H···O弱相互作用并存. 氢键网络分析体现了DMA水溶液结构中存在着不同的溶液结构区域. 随浓度和温度变化核磁共振化学位移值用于研究形成氢键的变化情况,并和模拟得到的结果进行比较,模拟和实验结果得到了较好的吻合.     

Studies on the structures and interactions of glutathione in aqueous solution by molecular dynamics simulations and NMR spectroscopy

All-atom molecular simulations and temperature-dependent NMR have been used to investigate the conformations and hydrogen bonds of glutathione (GSH) in aqueous solution. The simulations start from three different initial conformations. The properties are characterized by intramolecular distances, radius of gyration, root-mean-square deviation, and solvent-accessible surface. GSH is highly flexible in aqueous solutions in the simulations. Moreover, conformations can covert between “extended” and “folded” states. Interestingly, the two different hydrogen atoms in cysteine (H_N2) and glycin (H_N3) show different capabilities in forming NH?OW hydrogen bonds. The temperature-dependent NMR results of the different amide hydrogen atoms also show agreements with the MD simulations. Competing formation of GSH hydrogen-bonding interactions in aqueous solutions leads to hydrogen-bonding networks and the distribution of conformations. These changes will affect the activity of GSH under physiological conditions.     

Photochemical Processes in Aqueous Solutions of Immunoactive 8-Azasteroid

Based on an analysis of the absorption, fluorescence excitation, and fluorescence spectra, and the duration of the excited states of an aqueous solution (pH 7.4) of 2,3-dimethoxy-8-azagona-1,3,5(10),13-tetraen-12,17-dione molecules, the existence of two centers emitting longwave (L centers) and shortwave (S centers) fluorescence has been established. Irradiation of the solution accelerates the accumulation of L centers and considerably reduces the quantity of S centers that represent the initial molecule. Analysis of the induced-absorption spectra and their kinetics with picosecond time resolution shows that ionization of the molecule studied is the initial photochemical act and formation of a dehydro derivative of the initial molecule or protonation of carbonyl groups is the next act.     

纳米流体分散稳定性的分子动力学研究初探

纳米流体的制备和分散稳定性是纳米流体研究工作的前提。本文利用平衡分子动力学模拟方法,尝试从微观角度研究纳米流体的分散稳定性。以纳米颗粒Cu在液态CO_2中的分散稳定为算例,通过跟踪每个固体分子和液体分子的位置,分别观察了颗粒周围的液体吸附现象和颗粒的团聚现象。通过改变固液分子间的引力和斥力,观察其对颗粒周围液体分子的密...     

Molecular Dynamics Study of gases H2,D2 and T2

The classical Molecular dynamics simulation has been used to study the equation of state of gas H2,D2 and T2.It has also been investigated that the isotope mass affects on the accuracy of equation of state.Our calculated Iesults show that the classical effect is principal and the isotope mass effects on the equation of state are obvious for the much light gases.At the same time,some useful theoretical data of equation of state for these gases have been provided.It is found that the classical simulation is still effective to the quantum gas.However,the quantum mechanics simulation and the improvement of intermolecular interaction potential are necessary if more accurate computational results are expected.     

聚合物分子与官能化纳米管相互作用及扩散特性的分子动力学模拟

用全原子分子动力学方法研究典型聚合物分子（PE,PEO和PP）与碳纳米管（CNT）及官能化碳纳米管（FCNT）界面的相互作用及扩散特性.动力学模拟显示：—CH₃官能团具有减弱CNT与PE和PP的相互作用,但是,—CH₃官能化后的CNT与PEO之间确有增强作用.分析含氧官能团（—OH和—COOH）官能化的CNT与PE,PEO和PP的相互作用,可知含氧官能团的确具有增强表面相互作用的功能,而且含氧原子越多,相互作用就越强.此外,—CH₃,—OH,—COOH官能化后的CNT与PE,PP和PEO体系的总能量均减少,而且能量满足—COOH < —OH < —CH₃.分析非键相互作用势（库仑能和范德瓦尔斯能）,可知库伦相互作用是增强界面相互作用的主要作用能.官能化后的CNT/PE,CNT/PEO,CNT/PP体系的扩散系数都明显减小,且扩散系数大小满足—COOH < —OH < —CH₃.     

Phonon Dispersion and Thermodynamics Properties of CaF2 via Shell Model Molecular Dynamics Simulations

The phonon and thermodynamics properties of face-centered cubic CaF2 at high pressure and high temperature are investigated by using the shell model interatomic pair potential within General Utility Lattice Program （GULP）. The phonon dispersion curves and the corresponding density of state （PDOS） in this work are consistent with the experimental data and other theoretical results. The transverse optical （TO） and longitudinal optical （LO） mode splitting as well as heat capacity at constant volume Cv and entropy S versus pressure and temperature are also obtained.